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蜱虫（Tick）是一种传播人兽共患病的重要媒介。作为严格的吸血性节肢动物，蜱几乎可以叮咬陆地上所有的动物，且吸血时间长、吸血量大、生活史复杂。这些特点使蜱携带了最广泛的病原体种类，包括病毒、细菌、真菌、寄生虫；传播40余种疾病，如莱姆病、森林脑炎、克里米亚-刚果出血热、发热伴减少综合征、立克次体病、无形体病、巴贝西虫病等，可导致死亡或慢性后遗症，严重影响生活质量。
CRISPR-Cas系统有效地保护细菌和古细菌免受病毒和其他类型的外来DNA的侵害，但是，作为防御系统的特征，它们也给宿主带来不可忽视的适应成本，例如，自身免疫的风险和对外源有益基因的排斥。据推测，这些代价导致CRISPR-Cas在细菌中的频繁丢失，这反映在这种系统的斑片状分布上，甚至在亲缘关系较近的细菌菌株之间。然而，在目前的基因组序列数据库中，约40%的细菌和约90%的古细菌基因组携带CRIS...
美国圣犹达儿童研究医院迟洪波教授领导的研究小组发现了一种生物途径，可以选择性地调控关键免疫细胞：称为滤泡辅助性T细胞（Tfh）的发育及体液免疫反应。
这一发现为开发激活代谢途径的药物提供了希望，从而提高疫苗的有效性，包括那些预防COVID-19的疫苗。这些药物可以刺激免疫系统在免疫后产生更强烈的反应，产生更多的抗体来对抗病毒或细菌。
科研人员研发出4套基于CRISPR/Cas系统的病原体核酸检测工具（图）
CRISPR Cas系统 病原体 核酸检测工具
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2022/1/20
近日，中国农业科学院作物科学研究所作物分子育种技术和应用创新团队鉴定了RfxCas13d靶向RNA引发“反式切割”活性的基本特征，研制出基于RfxCas13d、LwaCas13a、LbCas12a与AsCas12a的多套核酸检测工具，并研发出田间实时可视化灵敏定性定量检测方法，为动植物病原体检测提供了高效、低成本的开发途径，具有广阔的技术开发场景与应用价值。相关研究结果在线发表在《中国科学:生命科...
中国科学院微生物研究所邱金龙团队开发了基于内源CRISPR系统的植物病原菌基因组编辑新方法（图）
中国科学院微生物研究所 邱金龙 CRISPR系统 植物病原菌 基因编辑 水稻白叶枯菌
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2022/4/22
高效便捷的基因组操纵技术可推动病原菌致病机理的研究。水稻是世界上主要的粮食作物，由水稻白叶枯菌（Xanthomonas oryzae pv. oryzae，Xoo）引起的水稻白叶枯病是威胁水稻生产的主要病害之一。近日，中国科学院微生物研究所的邱金龙团队利用水稻白叶枯菌内源CRISPR-Cas系统，建立了高效的基因组编辑方法，实现了对白叶枯菌的精准遗传修饰，相关研究成果以“Highly effici...
CRISPR-Cas 是细菌抵御噬菌体的免疫防御系统，由其介导的基因编辑技术发展迅速。其中 CRISPR-Cas13属于2类CRISPR系统中的Ⅵ型，它是用CRISPR RNA (crRNAs)编程，通过HEPN结构域特异性识别和切割单链RNA。Cas13a与crRNA结合后特异性识别靶RNA，HEPN结构域在靶RNA 结合后形成一个活化的HEPN催化位点。活化的HEPN催化位点表现出核糖核酸酶(...
Researchers at MIT’s McGovern Institute for Brain Research have discovered a bacterial enzyme that they say could expand scientists’ CRISPR toolkit, making it easy to cut and edit RNA with the kind of...
New programmable gene editing proteins found outside of CRISPR systems（图）
CRISPR系统 可编程基因 编辑蛋白 酶
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2023/6/20
Within the last decade, scientists have adapted CRISPR systems from microbes into gene editing technology, a precise and programmable system for modifying DNA. Now, scientists at MIT’s McGovern Instit...
2021年9月3日，国际学术期刊 Nucleic Acids Research在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心杨晟研究组完成的题为“Orthogonal CRISPR-associated transposases for parallel and multiplexed chromosomal integration”的研究论文。该研究挖掘到一种高活性新型CRISPR相关转座酶（CR...
Nat Chem Biol：使用两种CRISPR酶，无需扩增，就可在20分钟内高灵敏地检测SARS-CoV-2
Nature Chemical Biology CRISPR酶 检测 SARS-CoV-2
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2021/8/17
在一项新的研究中，由美国加州大学伯克利分校的Jennifer Doudna、David Savage和Patrick Hsu领导的一个研究团队开发出一种比qRT-PCR更快速、更容易部署的诊断测试方法。它如今结合了两种不同类型的CRISPR酶，以构建一种可以在不到一小时内检测出少量病毒RNA的测试方法。相关研究结果于2021年8月5日在线发表在Nature Chemical Biology期刊上，...
新疆野苹果（Malus sieversii）是我国珍贵的第三纪孑遗植物，也是世界栽培苹果(Malus domestica)的祖先种，具有丰富的抗性基因资源价值。近年来由于农田开发、过度放牧、人为砍伐、苹果小吉丁虫危害及腐烂病爆发等原因，新疆野苹果种群面积急剧减少，已被列为国家二级濒危保护植物。新疆野苹果保育及抗性基因资源挖掘利用迫在眉睫。由于新疆野苹果的自交不亲和性和较长的幼龄期，常规的育种方法很...
中国科学院新疆生态与地理研究所荒漠与绿洲生态国家重点实验室张道远研究组创制了新疆野苹果组培体系，使得再生体系缩短至2~3个月，此方法可用于大批量扩繁新疆野苹果克隆苗。
Cas12a属于II类V-A CRISPR系统，它是用CRISPR RNA (crRNAs)编程，通过RuvC结构域特异性识别和切割dsDNA或单链DNA (ssDNA)。Cas12a在识别其目标dsDNA时，可以释放单链脱氧核糖核酸酶(ssDNase)活性，不加区分地切割附近的ssDNA(即反式切割)。基于 CRISPR/Cas12a 系统的传感方法在恒温条件下就可以进行，不需要很高的温度，在一...
单细胞转录组学能提供不同人类细胞中基因表达的系统图谱，而下一项挑战则是系统性地理解细胞类型的特定基因功能，基于CRISPR的功能基因组学和干细胞技术的整合则能使得分化的人类细胞中的基因功能得到扩展化的分析。当细胞中的单个基因被开启或关闭时，其存在或缺失会影响细胞的功能和生存；日前，一篇发表在国际杂志Nature Neuroscience上题为“Genome-wide CRISPRi/a scree...