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中国科学院武汉植物园在小粒咖啡种质资源全基因组重测序解析研究上取得进展（图）
小粒咖啡 种质资源 基因
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2022/10/27
小粒咖啡（Coffea arabica）隶属于茜草科（Rubiaceae），是一种多年生的重要经济作物。随着全球对特色咖啡需求的显著增加，开发市场需求高的咖啡品种是必不可少的，埃塞俄比亚作为小粒咖啡基因库的主要来源，其种质资源具有很高的价值，可用于培养优良性状的品种。基因组重测序可以促进分子育种，且通过重测序分析产生的标记有助于推进传统作物育种方法，进而缩短开发新品种所需的时间。因此在咖啡中开发和...
为揭示毛竹重要变型的全基因组突变类型，选取4个有代表性的毛竹变型，采用高通量重测序技术，进行全基因组重测序，测序深度12×。分别提取毛竹4个变型与参考基因组间发生非同义突变的SNP、CDS区发生InDel与SV的基因，比较可以发现，2个秆形变异的竹种圣音竹和厚壁毛竹基因组的变异基因数目和变异类型相近，而2个秆色变异的竹种黄槽毛竹和黄皮花毛竹基因组的变异数目和变异类型相近。4个毛竹变型均存在多个基因...
2019年7月12日，西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室在基因组学领域国际知名期刊Genome Biology上发表了题为“Frequent intra- and inter-species introgression shape the landscape of genetic variation in bread wheat”的论文，揭示了六倍体小麦遗传多样性来源于频繁的与野生小...
基于重测序的染色体片段代换系定位水稻抽穗期QTL
水稻 染色体片段代换系 重测序 抽穗期
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2018/1/30
【目的】水稻的抽穗期是决定水稻产量及其适用性的重要农艺性状之一，是由多基因控制的数量性状。染色体片段代换系减少了个体间遗传背景的干扰，已经成为定位和克隆复杂性状QTL的重要材料。【方法】本研究以9311为受体，日本晴为供体构建的128个重测序的染色体片段代换系群体为试验材料，利用多元回归，结合Bin-map图谱，【结果】鉴定到6个在南京、扬州不同年份间稳定表达的抽穗期QTL，其中，qHD2.1被定...
我国完成31个大豆基因组重测序
31个 大豆基因组重 测序
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2010/11/16
由香港中文大学、华大基因研究院、农业部、中国科学院等单位合作的“大豆回家”项目研究成果，“31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和进化选择模式”2010年11月14日在国际著名杂志《自然—遗传学》上在线发表。