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本发明提出了一种基于空间相似性约束和非负矩阵分解的药物重定位方法和系统，包括数据收集模块、数据预处理模块、模型构建模块、模型求解模块、网络表示学习模块以及潜在药物预测模块，充分利用药物和病毒自身的属性信息以及高维空间中药物和病毒的关联关系，包括药物分子指纹图、病毒核酸序列信息以及网络拓扑特征，有效地解决在网络中由于引入新病毒节点所产生的行为信息缺失冷启动问题，准确地预测网络中分子的关联关系，为新病...