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本实用新型公开了一种测量细菌土壤原位迁移能力的实验装置，包括筒体，沿筒体侧壁插入若干管道，在所述的管道外套设有尼龙网袋，管道伸入筒体内的一端由尼龙网袋套住封口；在所述的筒体内、管道内均装填作物生长介质。本实用新型是单层插孔装置，以透明塑料筒为筒体，起支撑、植物培养作用，同时便于观察作物根系生长情况；以尼龙网袋作为封口膜，能够在限制植物根系向管道中生长的同时使管道中介质受植株根系活动的直接影响，同时...
本发明公开了一种基于16SrRNA扩增子测序检测土壤致病细菌生物污染的方法，其包括步骤为：步骤一、构建土壤非冗余致病细菌数据库；步骤二、完成对土壤/植物样品DNA的提取；步骤三、完成样品的16S rRNA基因测序，获得测序下机数据；步骤四、采用DADA2分析流程封装土壤非冗余致病细菌库，获得代表性序列；步骤五、将代表性序列与土壤非冗余致病菌数据库比对注释致病细菌，得到最终的ASV物种表，通过R语言...
南京农业大学资源与环境科学学院汪鹏教授课题组发现交叉互养土壤细菌能用砷作为武器提高生存和竞争力（图）
汪鹏 土壤细菌 砷转化 微生物群落
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2023/10/28
进一步研究发现，这两种细菌能够使用砷作为武器，进一步增强它们对抗其它微生物的集体竞争力（图2）。菌株Delftia sp.能将相对无毒的一甲基五价砷[MAs(V)]还原为毒性强的一甲基三价砷[MAs(III)]（一种抗生素），从而杀死或抑制竞争者，而菌株Bacillus sp.能将MAs(III)甲基化为无毒的二甲基五价砷DMAs(V)来解毒，从而不受MAs(III)的抑制作用。当菌株Delfti...
沈阳生态所在细菌来源碳的命运与土壤碳循环方面取得新进展（图）
细菌 土壤碳循 土壤微生物 土壤有机碳
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2023/7/9
土壤微生物的周转过程是有机质形成的重要驱动力，微生物残留物参与并调控土壤中的碳周转稳定过程，是土壤有机碳形成的主要途径。研究表明微生物来源碳可占土壤有机碳总量的50%以上，且在其贡献于土壤有机质过程中可能需经历多次循环。由于不同微生物的类群对底物的利用策略不同，因此微生物来源碳的周转过程不仅关乎微生物类群之间碳通量直接途径的重要信息，同时也可为微生物对土壤有机碳转化及积累的机制提供一定的价值。然而...
广东省农业科学院作物研究所在花生青枯病根际土壤细菌群落结构研究取得新进展（图）
花生根际 青枯病 土壤细菌 群落结构
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2023/5/6
近日，广东省农业科学院作物研究所花生研究团队在国际学术期刊International Journal of Molecular Sciences（中科院二区，Top，IF=6.208）在线发表题为“Silicon Application for the Modulation of Rhizosphere Soil Bacterial Community Structures and Metabol...
南京土壤所在代谢模型预测细菌多样性研究取得进展（图）
代谢理论 预测 细菌多样性 土壤微生物
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2023/7/17
土壤生物多样性极其复杂，通常少量土壤中就存在数十亿种生物，包括土壤微生物（细菌、真菌和原生生物）以及土壤动物（线虫）等。明确土壤生物多样性地理分布模式仍是一个巨大的挑战。以前的研究使用定性和图形框架等简单分析方法，仅仅包含少数共存物种或整体系统模型，侧重于突发模式但忽略了其潜在机制。著名生态学家James H. Brown等于2004年首次提出了定量评估不同尺度的系统中微生物多样性分布模式的框架，...
成都生物所在土壤-细菌界面作用对无机氮调控机制方面取得新进展（图）
土壤颗粒 细菌界面 无机氮调控
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2023/8/10
土壤中无机氮是所有植物体都必须的营养元素。通常认为亚高山森林土壤的低养分有效性受氨氧化细菌丰度和的多样性影响。然而，在农业和水生生态系统中，已有研究发现细菌-固体界面作用可以调控细菌的代谢活性和生物地球化学循环过程。忽略界面作用变化可能引起的土壤无机氮有效性的差异，很大程度上限制了对森林氮有效性利用策略和生态系统氮循环的认知水平。
2022年6月13日，植物学领域著名期刊New Phytologist在线发表了南京农业大学资源与环境科学学院土壤微生物与有机肥团队关于利用生物有机肥防控植物土传病害的最新研究成果：Bio-organic soil amendment promotes the suppression of Ralstonia solanacearum by inducing changes in the func...
中国科学院水土保持研究所在土壤碳激发效应过程中细菌群落结构演替研究方面获进展（图）
土壤碳激发效应 细菌群落结构 演替
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2022/9/21
近日，中国科学院水土保持研究所研究员李世清团队在细菌群落结构和土壤碳激发效应模式研究方面取得进展，相关成果以Dynamic changes in bacterial community structure are associated with distinct priming effect patterns为题发表在Soil Biology & Biochemistry上。
近日，水土保持研究所李世清研究员团队在细菌群落结构和土壤碳激发效应模式研究方面取得新进展。相关成果在本领域主流期刊Soil Biology & Biochemistry（学校双一流G2类刊物，中科院大类1区TOP期刊）发表题为“Dynamic changes in bacterial community structure are associated with distinct priming ...
2022年2月24日，南京农业大学生命科学学院生命科学学院沈振国教授团队和蒋建东教授团队合作在国际权威学术期刊《Microbiome》上在线发表了题为“Long-term effect of epigenetic modification in plant–microbe interactions: modification of DNA methylation induced by plant ...
近年来研究显示森林土壤甲烷汇能力显著下降。因此，增加对森林土壤中甲烷氧化细菌群落分布格局、构建机制和关键驱动因素的认识极为重要。此外，当前针对森林土壤甲烷氧化细菌群落的研究主要集中在某个或几个森林位点，从跨越多个气候带大尺度上开展森林土壤甲烷氧化细菌群落分布格局、构建机制和关键驱动因素的研究极度缺乏。
蓝藻细菌有望“激活”土壤（图）
水生蓝藻 可持续 有机氮肥生产
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2021/8/17
当世界各地的农业生产都在努力应对日益下降的土壤健康状况时，澳大利亚一支研究团队正在尝试一种可持续的有机氮肥生产。这种化肥由水生蓝藻生物制成，非常适合依赖化肥的严重退化地区。相关研究近日发表于Chemosphere。
中国科学院水生植物与流域生态重点实验室、中国科学院武汉植物园环境基因组学学科组万文结副研究员与杨玉义研究员，同中南民族大学何冬兰教授开展合作，以湖北神农架林区森林土壤为研究对象，使用Illumina MiSeq技术确定了含phoD基因细菌的组成和多样性，使用传统方法测定了土壤的理化性质；运用多种统计学分析方法以揭示含phoD基因的稀有种和丰富种细菌对环境的适应性和群落构建机制。
中国科学院南京土壤研究所王辉研究员团队与南京农业大学崔中利教授团队合作，利用16S rRNA基因测序技术，对长江流域6对有机和常规管理的农田土壤进行了捕食性细菌丰度分析，并为进一步探究不同施肥管理对土壤粘细菌群落的影响，相关成果发表在Applied Soil Ecology（2020）、Science of the Total Environment（2020）上，研究工作得到国家重点研发计划、国...