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鲍曼不动杆菌噬菌体AB3的全基因组测序及生物信息学分析
鲍曼不动杆菌 噬菌体 基因组 生物信息学
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2013/11/13
对本研究小组分离的鲍曼不动杆菌噬菌体AB3进行测序和基因组生物信息学分析，阐明其亲缘关系。 方法 采用鸟枪法和重叠群组装的策略对噬菌体AB3进行基因组测序，并通过EditSeq、tRNAscan-SE、TRF、FindTerm、ORF finder、BPROM、GeneMarkTM、Clustalx、phylip等软件对所获噬菌体AB3基因组的一般特性、编码基因的功能预测、R...
刺五加法尼基焦磷酸合酶基因的克隆、 生物信息学及表达分析
刺五加 法尼基焦磷酸合酶 克隆 表达分析
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2012/7/10
克隆刺五加的法尼基焦磷酸合酶(farnesyl diphosphate synthase,FPS)基因,并对其进行生物信息学和表达分析。方法: 采用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends, RACE)技术克隆刺五加FPS基因的全长cDNA序列。运用生物信息学方法对该基因进行分析,预测其编码蛋白的结构与功能。并通过RT-PCR法检测FPS在不同器官中的...
复杂性疾病生物信息学研究的策略与方法
复杂性疾病 生物信息学 策略 方法
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2009/7/24
本文简述近年来复杂性疾病生物信息学研究的策略与方法，并介绍清华大学生物信息学教育部重点实验室的有关工作. 由于遗传、环境的相互作用及基因型-表型复杂的内部结构，常用的家系研究、基于遗传图谱的连锁分析、基于物理图谱的定位克隆以及关联分析等单基因病策略与方法，在复杂性疾病的分子机制研究上存在局限. 在后基因组时代，生物信息学的发展，为从分子水平和系统观念研究复杂性疾病，以及研究模式从“序列→结构→功能...
目的:克隆丙型肝炎病毒(HCV)核心蛋白结合的肝细胞的蛋白基因，对新发现的基因及编码产物的结构与功能，及其基因表达的调节机制的结构基础进行生物信息学分析. 方法:应用酵母双杂交技术，以HCV的核心蛋白作为“诱饵(bait)”，筛选鉴定与其结合的肝细胞中蛋白的编码基因. 应用生物信息学(bioinformatics)技术，对其中筛选得到的人HCV核心蛋白结合蛋白6(HCBP6)全长基因及其编码产物的...
建立在芯片与生物信息学预测基础上的miRNA靶基因鉴定研究进展
miRNA 肿瘤 生物信息学
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2009/6/15
microRNA(miRNA)是一类长度约22个核苷酸(nt)的非编码单链小RNA分子。近年来，大量的研究证明，miRNA参与了许多重要的生物学过程，其异常表达在肿瘤的发生发展中扮演着癌基因或抑癌基因的角色。关于与肿瘤相关miRNA的实验研究方案通常包括4个步骤:①通过基因芯片技术对癌组织与配对的正常组织中差异表达的miRNA进行筛查，确定候选miRNA；②通过生物信息学软件对所获差异表达的miR...