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研究人员开发新方法发现新结构型非编码RNA及其调控功能（图）
非编码RNA 骨骼肌 三代单分子测序
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2024/4/16
人类基因组是由约30 亿个字符组成的遗传“密码本”，决定细胞和个体发育的命运。具有“暗物质”之称的非编码序列约占该“密码本”的98%，其中约80%能够转录成为“暗物质”核糖核酸（RNA）。这些“暗物质”RNA大多数都是不具有帽子结构的RNA（noncapped RNA，napRNA），它们绝大多数是在基因表达调控中扮演了重要角色的各种非编码RNA (ncRNA)。然而，目前的研究主要集中于具有帽子...
中国农业科学院植物保护研究所科研人员开发内源基因非编码区定向进化新技术
内源基因 非编码区 定向进化 新技术
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2024/4/22
近日，中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队开发了核酸酶LbCas12a介导的内源基因非编码区定向进化技术。相关研究成果发表在《植物通讯 (Plant Communications) 》。
高通量解析骨质疏松非编码易感变异被揭示（图）
骨质疏松 非编码 靶点
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2024/3/1
西安交通大学生命科学与技术学院杨铁林教授团队开发了一个增强子调控网络打分方法，鉴定了33个显著富集的转录因子，并发现这些转录因子显著富集到转录激活和骨代谢相关分子通路。近日该研究成果发表在《细胞基因组学》上。
科学家揭示淋巴瘤恶性转化过程中的非编码突变导致超级增强子重定位
淋巴瘤 科学网 胞苷脱氨酶 免疫球蛋白
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2023/12/16
低级别B 细胞非霍奇金淋巴瘤 (B-NHL) 虽然难以治愈，但通常相对惰性。然而，低级别的淋巴瘤可以转变为更具侵袭性的恶性淋巴瘤。例如，25-35% 的低级别滤泡性淋巴瘤 (FL) 患者经历从临床惰性状态转变为侵袭性且经常致命的弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL)。由于胞苷脱氨酶 (AID)在B淋巴瘤细胞中的活性，过去的有关FL 恶性转化的研究中报导了大量的AID介导的非免疫球蛋白位点相关的突...
非编码RNA调控骨骼肌发育研究取得进展（图）
骨骼肌发育 动物运动 代谢功能
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2023/9/13
骨骼肌约占成年动物体重的45%～60%，是维持动物运动和代谢功能的重要组织。经济动物骨骼肌纤维的数量和质量直接影响了产肉能力和肉品质，决定了动物的经济价值。动物肌纤维数量在胚胎期基本固定，出生后肌肉发育主要依赖于肌纤维的增生与肥大。近年来，大量研究表明“非编码RNA”可以靶向调控基因转录从而调节肌肉生长发育。
Mol Plant｜南昌大学王东团队和中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风团队揭示了长链非编码RNA DANA2调控植物干旱应答的分子机制（图）
Mol Plant 南昌大学 王东 中国科学院 曹晓风 长链非编码 植物干旱
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2023/10/11
2023年8月7日，Molecular Plant在线发表了南昌大学王东教授团队和中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风院士团队题为“The long non-coding RNA DANA2 positively regulates drought tolerance by recruiting ERF84 to promote JMJ29-mediated histone demethylat...
中国科学院植物研究所研究人员在长链非编码RNA调节植物抗冻特性研究中取得重要进展（图）
长链非编码 RNA 植物抗冻 低温胁迫
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2023/9/19
中国科学院植物研究所张文浩研究组的研究发现，苜蓿CBF/DREB1s基因间长链非编码RNA MtCIR2能够在常温下诱导CBF/DREB1s表达，增加植物的抗冻性。在常温下生长的MtCIR2超表达株系中，CBF/DREB1s表达大幅度增加，其抗冻性也显著高于野生型。MtCIR2缺失突变体中，CBF/DREB1s表达量显著降低，对低温冷冻胁迫极其敏感。该研究还发现，MtCIR2通过调节糖代谢，影响细...
中国科学院生物物理研究所专利：一种针对东亚人群全基因组范围内的非编码区的SNPs的DNA芯片
中国科学院生物物理研究所 专利 东亚人群 全基因组范围 非编码区 SNPs DNA芯片
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2023/6/2
中国科学院生物物理研究所专利：一种针对东亚人群全基因组范围内的非编码区的SNPs的DNA芯片
中国科学院植物所研究人员在长链非编码RNA调节植物抗冻特性研究中取得重要进展（图）
非编码RNA 植物抗冻特性 靶基因
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2023/6/11
低温胁迫是限制植物生长和地理分布的主要环境因子，严重影响农作物的产量和品质。植物经过长期的进化过程，形成了适应低温胁迫的生理和分子机制。例如，大多数温带植物都具有低温驯化特性，即在非冻的低温环境生长一段时间后，其抗冻能力显著提高。目前已知的调节低温驯化过程的主要分子机制主要为CBF/DREB1s途径。低温快速诱导转录调控因子CBF/DREB1s表达，CBF/DREB1s通过调节抗冻相关基因表达，增...
中国科学院生物物理研究所专利：一种针对欧洲人群全基因组范围内的非编码区的SNPs的DNA芯片
中国科学院生物物理研究所 专利 欧洲人群 全基因组范围 非编码区 SNPs DNA芯片
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2023/6/1
中国科学院生物物理研究所专利：一种针对欧洲人群全基因组范围内的非编码区的SNPs的DNA芯片
中国科学院生物物理研究所专利：一种用于肝癌与肝癌微环境相互作用的新的长链非编码RNA检测及其应用
北京基因组所（国家生物信息中心）马利娜副研究员等应邀在国际权威综述期刊Nature Reviews Molecular Cell Biology发表长非编码RNA数据库评述文章
马利娜 非编码RNA数据 蛋白编码
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2023/7/6
202年5月23日，中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)马利娜副研究员应Nature Reviews Molecular Cell Biology 邀请，联合章张研究员，发表题为“The contribution of databases towards understanding the universe of long non-coding RNAs”的评述，系统总结了长非编码RNA...
国农业科学院蔬菜花卉研究所研究发现基因组中保守非编码序列参与植物远程基因互作的新机制（图）
基因 非编码序列 植物远程
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2023/2/19
真核生物染色质以三维折叠的方式存在于细胞核，这种空间结构参与细胞的重要生命活动。细胞中的基因表达受到转录因子（TFs）和增强子等蛋白因子调控，它们的互作影响染色质三维结构。保守非编码序列（CNSs）参与募集TFs和增强子等调控蛋白，然而CNSs是否参与远程基因互作尚不清楚。
中国农业科学院蔬菜花卉研究所研究发现基因组中保守非编码序列参与植物远程基因互作的新机制（图）
基因 非编码序列 植物远程
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2023/3/18
真核生物染色质以三维折叠的方式存在于细胞核，这种空间结构参与细胞的重要生命活动。细胞中的基因表达受到转录因子（TFs）和增强子等蛋白因子调控，它们的互作影响染色质三维结构。保守非编码序列（CNSs）参与募集TFs和增强子等调控蛋白，然而CNSs是否参与远程基因互作尚不清楚。
科学家揭示心脏发育轨迹和先天性心脏病相关的非编码突变
心脏发育轨迹 先天性心脏病 非编码突变
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2024/1/23
美国斯坦福大学研究人员对发育中的心脏建立了综合单细胞数据的联合图谱，并利用深度学习揭示心脏发育轨迹和先天性心脏病相关的非编码突变。该研究成果于近日发表在《Cell》杂志上，题为：Integrative single-cell analysis of cardiogenesis identifies developmental trajectories and non-coding mutation...