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借助斑马鱼EST数据库从鲤鱼微卫星序列中寻找蛋白编码基因(英文）
鲤鱼 in silico 微卫星标记 Blast
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2009/6/23
应用 in silico的方法，利用Blastn 和Blastx 搜索引擎，将鲤鱼微卫星序列与GenBank数据库进行同源序列比对。利用Blastn，将侧翼序列长度>50 bp的875个鲤鱼微卫星序列与斑马鱼的EST数据库首先进行比对，结果找到了121个同源序列。随后采用Blastx搜索蛋白质数据库，有94个微卫星位点存在同源蛋白。除了33个假定和3个未知蛋白外，剩余的58个微卫星位点被成功地进行...
不同结构的蛋白编码基因的密码子偏性研究
密码子使用(Codon usage) 蛋白质三级结构(Protein tertiary structure) 聚类分析(Cluster analysis)
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2008/3/5
利用聚类分析方法,对两类具有不同三级结构的75个蛋白的编码基因的密码子使用偏性进行了分析。75个基因样本序列按照对应蛋白的三级结构被很清晰的分成了两类,从而发现密码子的使用与蛋白质的三级结构有很大的相关性。这一重要结果证实了DNA的一维信息中蕴含着蛋白质的三级结构信息。CODON USAGE IN GENES CODING FOR PROTEINS
WITH DIFFERENT TERTIARY...
生物谷博客报道：Xist基因的非编码性RNA是真哺乳亚纲哺乳动物(eutherian mammal)中X染色体失活过程的关键性起始物，然而它的精确功能和起源仍然不清楚。尽管Xist在真哺乳亚纲保守性较好，但在其他的哺乳动物动物中还未找到它的同源物。作者显示Xist至少部分上是从一个编码蛋白的基因进化而来的，而Xist原始类型(proto-Xist)的蛋白编码功能的丢失与Xist两端存在着四个蛋白编...