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土木工程学院源于学校成立较早的教学单位森林工业系，2011年学校进行院系调整，在原交通机械与土木工程学院之森林工程、土木工程、给排水科学与工程专业的基础上，融入原资源学院的测绘工程和原保护生物学院的消防工程专业，成立了土木工程学院。2017年消防工程专业从土木工程学院分出独立建院，2019年再次并入土木工程学院。
东北林业大学土木工程学院林区交通工程博士点
东北林业大学土木工程学院 林区交通工程 博士点
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2013/4/12
林区交通工程博士点学科系国家一级学科——林业工程学科下的二级博士点学科，以道路与铁道工程、桥梁与隧道工程、管理科学与工程工程等三个硕士点学科为支撑。学科现有道路网的规划、道路工程、桥梁工程、岩土工程、工程经济共5个研究方向。本学科现设置桥梁工程总论、交通规划2门学位课；悬索结构设计、工程经济专题、建设法律制度、道路工程学4门选修课。