搜索结果: 1-15 共查到“知识库 水产学 基因组”相关记录15条 . 查询时间(0.335 秒)
皮特不动杆菌是一种新兴的鱼源致病菌，为了对该菌的致病机理进行研究并为该菌引起的鱼类疾病防治提供技术储备，实验选取皮特不动杆菌菌株Ap-W20进行了全基因组测序，并对其毒力特征进行了分析。结果发现，Ap-W20全基因组序列总长为4 399 705 bp，GC含量为38.78%，共预测到4 230个编码序列(CDS)，存在4个质粒，GenBank数据库登录号为CP027658~CP027662。ANI...
为了探究东方鲀属内系统发育关系，本研究首次基于群体尺度对东方鲀属物种进行系统发育分析。利用线粒体基因组，在包含10个种的124尾东方鲀中，挖掘了1 488个单核苷酸多态性(SNP)位点和4个插入缺失(INDEL)，使用这些遗传变异位点进行了系统发育及群体遗传学分析。发现网纹东方鲀与铅点东方鲀可能是同种异名，且二者形成的姊妹群位于东方鲀属基部；暗纹东方鲀与红鳍东方鲀、菊黄东方鲀与双斑东方鲀各自亲缘关...
为研制可降解污染物的高效微生物制剂，本研究从污水中分离到多株可高效降解化学耗氧量(COD)的菌株。通过16S rDNA测序及生理生化分析，鉴定出其中一株为枯草芽孢杆菌，命名为Bacillus subtilis H2。对其进行进化树构建，发现该菌株与B. subtilis strain SCUT09的同源性高达98.8%。细菌最适生长条件探究发现，该菌株的最适生长条件：温度为42 °C、pH值为6....
4种鲇基因组中Tc1/Mariner转座子的鉴定与演化
鲇 基因组 转座子 Tc1/Mariner / 演化分析
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2020/11/24
为了探讨Tc1/Mariner转座子在4种鲇(沟鲇、黑斑原、鲇和南方鲇)中的特征及在演化过程中的作用，实验使用de novo预测和同源预测两种方法鉴定了4种鲇基因组中的Tc1/Mariner转座子并进行演化分析。通过对所获得序列的统计及分类，结果显示，4种鲇基因组中Tc1/Mariner转座子的含量分别为9.46%、2.70%、7.83%和8.54%，并且分别被分为38、20、43和55个家族。...
水产生物基因组研究进展与趋势
水产生物 基因组 下一代测序
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2020/2/28
本文综述了水产生物基因组研究相关技术的发展历程和关键技术的应用。以二代测序技术的出现为分界点，首先回顾了早期水产养殖生物在遗传学和分子生物学方面的研究结果，以及为开展全基因组测序所做的相关基础研究，然后重点介绍了二代测序技术应用于水产生物全基因组测序和经济性状遗传基础解析的研究进展，最后展望了水产生物基因组研究发展趋势。水产生物经济性状遗传机制高度复杂，从全基因组角度阐明其遗传机制仍有很多难题，但...
本文回顾了我国鱼类基因组研究从无到有、从小到大的十年发展历程。分别介绍了我国在鱼类BAC文库构建、高密度遗传连锁图谱构建与QTL定位、全基因组测序和精细图谱绘制、基因组选择育种和基因组编辑等方面取得的重要进展和成果。结合国际上鱼类基因组研究进展，通过分析、比较指出，从2008—2013年，我国鱼类基因组研究在国际上处于全面跟跑状态，从2014—2018年，我国水产科学家奋起直追，加快鱼类基因组研究...
嗜麦芽寡养单胞菌是近年来引起斑点叉尾鮰暴发高致死性传染病的主要病原之一。为了对防治该病提供技术储备，本研究对嗜麦芽寡养单胞菌 XH.SM.1菌株进行全基因组测序与比较基因组学分析，同时用扫描电镜观察其超微形态特征。电镜观察显示，XH.SM.1为两端钝圆的短杆状细菌，菌体平均长度(1.73±0.35) μm，平均直径(0.43±0.04) μm。全基因组测序得到XH.SM.1基因组大小为4.56 M...
罗非鱼无乳链球菌强毒株基因组表达文库的构建及鉴定
尼罗罗非鱼 无乳链球菌 基因组表达文库
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2015/12/30
为了筛选罗非鱼（Oreochromis niloticus）无乳链球菌（Streptococcus agalactiae）在鱼体内特异诱导表达基因，该研究构建了罗非鱼无乳链球菌强毒株Hod-1的基因组表达文库。采用Sau3AⅠ对无乳链球菌菌株Hod-1基因组DNA进行不完全酶切，回收大小为0.5~2.0 kb的DNA片段，并与经BamHⅠ单酶切且去磷酸化的pET-28 a/b/c表达载体连接，转化...
滁州鲫(Carassius auratus)线粒体全基因组序列分析及系统进化
滁州鲫 线粒体基因组 系统进化分析
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2015/12/2
为探讨天然三倍体滁州鲫的系统进化地位，采用直接测序法获得滁州鲫线粒体基因组。其序列全长为16581 bp，碱基组成为31.6% A、26.2% T、16.1% G和26.1% C，包括13个蛋白质基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个非编码区，各基因的位置及组成与已公布的鲤科鱼类一致。除tRNA-Ser (AGY)外，其他21个tRNA的二级结构均具有典型的三叶草结构；13个蛋白编码基因...
利用长PCR扩增获得太平洋磷虾的线粒体DNA，结合鸟枪法和引物步移法测定太平洋磷虾的线粒体基因组。结果表明，太平洋磷虾线粒体基因组全长为16 898 bp，在最大非编码区中存在一个串联重复区域（4.7×154 bp）。在15个主编码基因中，变异位点数最多的是nad5基因（319~321个），其次为nad4基因（284~285个）和cox1基因（232~233个）。因此，nad5基因和nad4基因可...
综合分析了软骨鱼10个物种的线粒体基因组全序列，全面揭示软骨鱼线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因和差异位点等。软骨鱼10个物种线粒体基因组均编码后生动物标准的37个基因，而且其基因排列完全相同。真鲨目和鳐形目线粒体基因组的13个蛋白质编码基因的Ka/Ks比值都远远低于1(0.019 1~0.156 4)，显示出较强的纯化(负)选择。基于线粒体基因组构建的系统发育树结果显示，软骨鱼纲分为两支：全...
2 种方法提取日本沼虾基因组DNA
日本沼虾 基因组DNA 提取方法
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2009/4/24
以日本沼虾的尾部肌肉为材料, 采用苯酚- 氯仿法和氯化钠法提取日本沼虾基因组DNA, 并对2 种方法提取的结果进行了紫外
分光光度、琼脂糖凝胶电泳、PCR 扩增等方法的鉴定。结果表明:2 种方法提取的日本沼虾基因组DNA 浓度分别为3 165 .8 和396 .5
ng/ μl , OD260/ OD280 比值分别为1 .76 和1 .63 , 均能满足分子生物学研究的需要。
颈链血苔虫线粒体基因组的测定及其系统发育学意义
颈链血苔虫 线粒体全基因组 系统发生 基因排列顺序
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2015/5/28
本研究测定了颈链血苔虫的线粒体基因组。它是一个双链闭合环状分子，全长14144 bp，与其他后生动物相比相对较小；颈链血苔虫线粒体基因组所有的基因都编码在同一条链上。相比其他后生动物它具有独特的基因排列顺序，而且与已发表的两个苔藓动物线粒体基因组相比，基因排列顺序也显著不同，这说明苔藓动物线粒体基因组经历了大规模的基因重排过程。基因排列顺序比较分析的结果支持苔藓动物为原口动物的观点，提示我们基因排...
对虾白斑杆状病毒功能基因组的研究与应用
对虾白斑杆状病毒 功能基因 病毒纯化
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2008/10/8
课题采用基因芯片技术开展了WSSV病毒基因组转录研究，通过分析不同感染时间的病毒基因组表达谱，初步确定了20多个WSSV早期基因，另外通过不同年份病毒株的基因组表达谱分析，揭示了各基因的表达水平，并且还发现了一些可能起着重要作用的高表达基因。另外通过基因克隆表达和活性测定完成了3个与病毒核酸代谢相关的基因功能鉴定，其中WSSV-ts和WSSV-dut与病毒核苷酸合成相关，WSSV-nsn与核苷酸降...
牙鲆淋巴囊肿病基因疫苗与功能基因组的研究
牙鲆 淋巴囊肿病基因 疫苗
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2008/9/18
该课题以危害我国海水养殖鱼类的病毒病-----淋巴囊肿病为对象，开展了基因疫苗和病原基因组学的研究。课题通过构建cDNA文库和克隆基因，筛选出LCDV-cn的候选基因，构建了真核表达载体并证明能在牙鲆中有效地表达目的基因。率先研制了牙鲆淋巴囊肿病毒针核酸探针-点杂交试剂盒，其探针灵敏度达到了50 pg，特异性较好。用诊断试剂盒对连年发病的养鱼场50条目测无肿瘤症状牙鲆（平均体重250克）进行了L...