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中国科学院分子植物科学卓越创新中心科研成果：水稻广谱抗稻瘟病基因的克隆及分子标记
水稻 抗稻瘟病 基因克隆 分子标记
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2023/3/23
本发明涉及水稻广谱抗稻瘟病基因的克隆及分子标记。首次筛选到一份抗性广谱突出的籼稻品种，并进而找到该品种中含有的具有广谱抗病性的显性基因，定名为 Pigm1。基于该基因，可制备抗病能力增强的转基因植物，或制备出鉴定植物抗病能力的分子标记物。本发明还提供了特异性鉴定 Pigm1 的分子标记物。
中国水产科学研究院黑龙江水产研究所由程磊等人完成的“一种用于鉴别鲤、鲫和鲤鲫间杂交鱼的分子标记及其引物与应用” 获国家发明专利授权，专利号：ZL201810886217.5。本专利基于基因组学知识，发明一种用于鉴别鲤、鲫和鲤鲫间杂交鱼的分子标记及其引物。该分子标记的引物对可以有效鉴别鲤、鲫和鲤鲫间杂交鱼，在基因层面上提供了一种鉴别鲤、鲫及鲤鲫间杂交鱼的方法。本发明有效地避免了鲤、鲫和鲤鲫间杂交鱼外...
广东省农业科学院果树研究所首次利用自主构建的荔枝cDNA文库、转录组数据库、基因组测序及重测序数据库，大规模开发荔枝EST-SSR和SNP分子标记，并成功应用于荔枝育种领域，率先建立起荔枝EST-SSR与SNP分子标记辅助育种技术平台，创建了广东省荔枝分子标签工程技术研究中心，相关科技成果获2019年度广东省科学技术进步奖二等奖。
樱桃种质SCoT分子标记与叶片表型性状关联分析
樱桃 SCoT标记 叶片性状 关联分析
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2021/3/12
利用本研究中建立的樱桃SCoT标记分析体系，进行适宜引物筛选，进而对12个樱桃品种进行SCoT分子标记、叶片表型性状遗传多样性及两者关联分析。结果显示：从102条SCoT标记引物中筛选出46条适宜樱桃遗传分析的标记引物，筛选率达45.1%；参试的18条SCoT引物共获得等位位点数77个，其中多态性位点65个，多态性比率84.4%；12个樱桃品种的表型叶片性状变异系数为11.49% ~ 36.93%...
基于SCoT分子标记的甘薯及其野生种遗传多样性分析
甘薯 SCoT分子标记 遗传多样性 遗传结构
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2021/3/31
为揭示甘薯及其野生种之间的遗传多样性，分析甘薯及其野生种之间的遗传关系，利用SCoT分子标记对22份甘薯及其野生种三浅裂野牵牛和三裂叶薯的PCR扩增结果、遗传多样性、进化关系、群体结构进行分析。结果表明：43条SCoT引物共检测到278条稳定条带，每条引物可检测4~12个条带； SCoT-8、SCoT-20、SCoT-26、SCoT-36、SCoT-35 5条引物多态性丰富，可用于甘薯及其野生种研...
在ph1b纯合基因型中,普通小麦部分同源染色体和外源染色体能够发生配对和重组。为通过分子标记辅助育种技术高效利用 ph1b突变体进行异源有益基因转移,以11个小麦材料为试材,比较了9个已报道的 Ph1的PCR分子标记。在9个分子标记中,标记OPR7和OPR17不具有特异性,标记PhSCAR、Mads、Ph920、PSR128、PSR574、PSR2120和WPG90为显性标记,仅标记PhSCAR为...
分子标记辅助选择培育低直链淀粉含量抗除草剂水稻
水稻 咪唑乙烟酸 四引物扩增受阻突变体系PCR Wx-mq 分子标记 低直链淀粉
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2021/4/2
为了提高水稻的食味品质和生产实践，培育了低直链淀粉含量和抗咪唑啉酮类除草剂2种性状兼顾的水稻新品系。利用带有低直链淀粉含量的南粳9108作为软米基因的供体，与显性核不育分离群体中不育单株进行杂交，并用南粳9108作为轮回亲本回交2次得到BC2F1群体，利用Wx-mq基因存在单核苷酸变异，对BC2F1群体的单株进行四引物扩增受阻突变体系PCR（Tetra-primer ARMS-PCR）扩增，依据其...
大豆分枝数相关分子标记开发及qBN-18位点精细定位
大豆 分枝数 QTL定位 候选基因
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2020/12/29
分枝数是影响大豆产量的重要因素之一, 与植株结荚率直接相关; 同时也是决定大豆株型的重要组成因子, 并通过调节群体结构、种植密度等进一步影响产量。目前关于大豆分枝数QTL (quantitative trait loci)精细定位与图位克隆的报道极少。因此, 发掘参与调控大豆分枝的基因/QTL对于株型建成的基础研究和高产品种培育的应用研究都具有重要意义。本研究在少分枝品种垦丰19 (KF19)与多...
选取海南大学油梨种质资源圃的‘Fuerte’油梨花朵和小果进行转录组测序，获得18 010条序列，总长度为29 422 056 bp。利用MISA软件检索转录组测序数据，获得分布于4 687个序列中的6 312个SSR位点。经统计发现，SSR在所检测的序列中出现的频率为35.05%。分析SSR位点特征显示，所有类型的SSR平均长度为18.90 bp，SSR之间的平均距离为4.66 kb。‘Fuer...
为了加快辣椒抗疫病新品种选育进程，选育抗疫病品种是防止或减轻辣椒疫病危害的有效途径。随着分子生物学的不断发展，辣椒分子标记辅助育种成为选育抗病品种快速有效的方法。利用分子标记技术对40份辣椒材料进行了抗疫病基因的分子标记筛选，同时对已报道的6个抗疫病分子标记进行鉴定。鉴定结果表明：3个STS抗疫病分子标记Phy-1、Phy-4和Phy-6扩增出特异性目标条带，共鉴定出18份抗疫病材料和2份感病材料...
烟草花叶病毒属（Tobamovirus）病毒是危害我国辣椒生产最重要的病毒之一，其中辣椒轻斑驳病毒（PMMoV）近些年来危害日趋严重。L 系列等位基因（L1、L2、L3、L4）是抗烟草花叶病毒属的主要抗性基因。为了提高辣椒品种烟草花叶病毒属病毒和马铃薯Y 病毒（PVY）抗性，本试验分别以CM334（抗PVY，含Pvr4 基因）和引进材料200375（抗PMMoV，含L4 基因）为抗源，以甜椒自交系...
韭菜全长转录组SSR信息分析及分子标记开发
韭菜 全长转录组 SSR 无融合生殖
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2020/6/18
利用MISA软件筛选韭菜（Allium tuberosum）全长转录组测序获得的49 876条（大于500 bp）转录本序列（89.44 Mb），共检测出13 111个SSR位点，分布在10 332条转录本中，SSR出现频率为26.29%，平均分布距离为6.82 kb。在搜索的6种SSR位点类型中，1 ~ 3个核苷酸重复类型占主要地位，占总SSR位点数的98.74%，其中单核苷酸、二核苷酸和三核苷...
稻瘟病广谱抗性基因Pigm特异性分子标记的开发和应用
稻瘟病 Pigm 特异性标记 四引物扩增受阻突变体系PCR 竞争性等位基因特异性PCR
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2020/4/10
【目的】来自籼稻品种谷梅4号的Pigm是一个对稻瘟病菌具有广谱和持久抗性的重要基因。为有效提高Pigm基因的选择效率，有必要开发具有特异性的共显性分子标记进行辅助育种。【方法】本研究根据谷梅4号Pigm位点存在的特异性核苷酸变异，利用Tetra-primer ARMS-PCR和KASP两种不同的基因分型技术开发出分子标记T-Pigm和K-Pigm，对不同品种(品系)以及淮稻9号/谷梅4号的F2分离...
对香椿进行染色体核型分析和SSR分子标记的开发。染色体核型分析发现两个居群的香椿染色体数都是56条，为2A型，香椿的染色体较为原始，变异较小。转录组测序结果共获得66 921条Unigene，从中检索得到13 324个SSR位点，分布于11 184条Unigene中，SSR出现频率为19.91%，平均分布距离为3.84 kb。优势重复基序为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸，分别占SSR总数的62.33...