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近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的人类癌症代谢物关联知识库（MACdb）正式上线。该研究成果以“MACdb: A curated knowledgebase for metabolic associations across human cancers”为题在Molecular Cancer Research 期刊在线发表。
近日，中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)杨运桂研究员、中国农业大学韩建永教授、中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)杨莹副研究员和郑州大学第一附属医院孙莹璞教授以共同通讯作者在Nature Communications 杂志上发表了题为“scm6A-seq reveals single-cell landscapes of the dynamic m6A during oocy...
中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）发布同源基因数据库HGD（图）
同源基因数据 HGD 微生物 北京基因组研究所
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2023/4/19
同源基因是指来源于共同祖先的基因，常用于研究基因进化过程以及推断基因的潜在功能，在进化基因组研究以及系统生物学的功能研究中具有重要价值。
髓母细胞瘤是儿童最常见的恶性脑肿瘤之一，具有WNT、SHH、G3和G4四个分子分型。其中SHH-MB的发生源于hedgehog信号通路持续激活引起小脑颗粒神经元前体细胞过度增殖，由于其内部异质性强、病人预后相差很大等临床问题，目前尚缺乏有效的靶向治疗方法。N6-甲基腺苷（N6- methyladenosine, m6A）是哺乳动物mRNA最常见的表观转录标记，能够调节RNA出核、降解和翻译等多个R...
尿路上皮癌 (UC) 是泌尿生殖系统最常见的恶性肿瘤之一，包含上尿路上皮癌和膀胱癌。虽然都起源于尿路上皮细胞，但上尿路上皮癌恶性程度更高，诊断时60%的患者已经发生肌层浸润，而膀胱癌患者发生肌层浸润的比例仅15-25%。越来越多的证据表明DNA甲基化与肿瘤的进展紧密相关。肌层浸润和非肌层浸润的膀胱癌具有不同的DNA甲基化模式，同时与临床预后相关。
中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)合作揭示肾癌和癌栓肿瘤微环境差异（图）
肾癌 肿瘤 癌栓 北京基因组研究所
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2023/4/19
肾癌伴癌栓生长是肾癌恶性特征之一。约10%-30%晚期肾癌患者合并肾静脉或下腔静脉癌栓。未经治疗的肾癌癌栓患者自然病程短，预后差。根治性肾切除及下腔静脉癌栓取出术可有效改善预后，但手术难度大，围手术期并发症多。虽然目前术前新辅助治疗可有效缩小肿瘤体积，降低手术难度及风险。但多项临床研究发现肾癌和配对癌栓对同种治疗方案差异较大。而基于bulk组学测序分析找到差异有限。因此亟需提高对肾癌和癌栓的深入认...
