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中国农业科学院棉花研究所专利：与棉花隐性芽黄基因V1紧密连锁的SSR标记及其应用
棉花 隐性芽黄基因 V1 SSR标记
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2024/5/6
本发明公开了与棉花隐性芽黄基因v1紧密连锁的SSR标记及其应用。本发明提供了用于鉴定芽黄棉花的成套引物，所述SSR标记VS2的引物对VS2由序列表序列1和序列2所示的单链DNA组成；所述SSR标记VS14的引物对VS14由序列表序列3和序列4所示的单链DNA组成；所述SSR标记VS18的引物对VS18由序列表序列5和序列6所示的单链DNA组成。本发明提供的引物对VS2和/或引物对VS14和/或引物...
中国林业科学研究院热带林业研究所专利：一种快速鉴别茶梅品种的SSR标记引物、方法及应用。
近日，宁夏农林科学院枸杞科学研究所枸杞种质资源与育种创新团队组织撰写《枸杞SSR分子标记开发及种质资源指纹图谱》由中国农业科学技术出版社公开出版发行。
一组新的小麦EST-SSR标记开发及其在遗传图谱构建中的应用
小麦 EST-SSR标记 遗传图谱 RIL
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2021/4/7
为了丰富小麦功能分子标记的数量，为小麦功能基因的定位、比较基因组学、小麦起源和进化等方面的研究奠定基础。从前期利用小麦转录组数据鉴定出的8 389个EST-SSR序列中，随机选取585对引物得分大于95的标记进行分析，以川麦42和川农16杂交后自交获得的重组自交系群体为试验材料，利用新开发出的EST-SSR标记，并结合SSR标记和SRAP标记，构建了一张遗传图谱。结果表明，585对EST-SSR引...
鉴定出与纤维产量相关性状连锁的SSR标记有助于黄麻纤维产量的分子标记辅助育种。本研究以311份黄麻种质资源为研究材料, 通过2016—2018年表型鉴定, 结合116对SSR引物扩增出397个SSR标记, 利用SPSS软件对SSR标记与纤维产量性状进行相关性分析。结果表明, 311份黄麻种质资源9个纤维产量性状的变异系数范围为13.05%~76.78%, 表现出广泛的遗传变异。农艺性状相关分析表明...
基于表型和SSR标记筛选海岛棉优异种质资源
海岛棉 表型 SSR标记 优异种质
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2020/4/26
【目的】筛选海岛棉某一性状特别突出的优异种质资源，加快其新品种的选育进程。【方法】本研究以178份海岛棉核心种质资源为试验材料，通过调查和测定铃重、单株铃数、衣分、纤维长度、纤维比强度和马克隆值6个性状的表型数据，开展变异度和遗传多样性分析。每个性状表型值按10%最优取样策略，初步筛选海岛棉优异种质资源；同时利用120对simple sequence repeat （SSR）引物对178份海岛棉核...
菜薹品质性状与SSR标记的关联分析
菜薹 品质性状 SSR标记 关联分析
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2019/11/5
为挖掘与菜薹品质性状相关的分子标记，选用具有多态性的84个SSR标记分析了81份菜薹种质材料的遗传多样性，并采用TASSEL3.0软件中混合线性模型（MLM）对菜薹群体材料的单株质量、叶绿素含量、维生素C含量、可溶性总糖含量、可溶性蛋白含量和硝酸盐含量等6个品质性状进行关联分析。结果显示，84个SSR标记在81份菜薹种质材料中共检测出310个等位位点，引物多态信息量（PIC）在0.1878 ~ 0...
泥蚶生长性状与SSR标记的相关性
泥蚶 SSR标记 生长性状 相关分析
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2020/5/20
泥蚶生长性状属于数量性状，为了筛选与泥蚶生长性状位点连锁的分子标记，本研究以150颗选育品系F4泥蚶为对象，利用12个SSR位点进行生长性状关联分析。对生长性状的相关分析表明，各数量性状之间的相关系数均达到极显著水平，其中壳高与活体质量的相关系数最大(0.930)，壳长与活体质量次之(0.927)；但通径分析显示，对活体质量直接影响最大的是壳宽(0.431)，壳长次之(0.332)，决定系数与以上...
龙眼EST-SSR标记开发及无患子科5个属种质遗传多样性分析
无患子科 龙眼 SSR 转录组
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2019/8/6
基于龙眼品种‘香脆’果实的转录组测序数据库，开发龙眼EST-SSR引物，评价其在无患子、红毛丹、荔枝、龙荔等4个近缘属植物上的通用性，并进行无患子科5个属55份种质的遗传多样性分析。在13 934条龙眼Unigene中搜索到SSR位点6 683个，SSR发生频率为47.96%，平均分布距离为4.48 kb；单、二和三核苷酸重复是主要的SSR类型，分别占52.78%、26.25%和20.19%；设计...
目的 研究千里光过氧化物酶（peroxidase，POD）基因结构特征和功能的关系，并根据其核苷酸序列设计SSR引物，进一步验证其在多个千里光地方种中的多态性。方法 从千里光全长cDNA文库中分离到POD全长序列，运用系列生物信息学软件进行核苷酸与氨基酸的序列特征分析，分析序列中的SSR位点并对多个千里光品系进行PAGE检测和验证。结果 基因具有典型的POD结构特征，表现出高度的保守性。PAGE电...
为获得更多用于构建甘蔗遗传连锁图谱可用的多态性SSR标记,本研究以6个高抗甘蔗褐锈病品种和6个高感甘蔗褐锈病品种为亲本,根据感病母本×抗病父本选配12个杂交组合,筛选在亲本间条带清晰、多态性明显、重复性较好的引物。结果表明,组合柳城03-1137×德蔗93-88、Mex105×粤糖00-236亲本间的多态性引物数最多,分别占总数的52.38%和47.62%;其中,10对引物(18-mSSCIR34...
基于表型性状及分子标记对丽江不同油橄榄品种进行遗传多样性分析,对品种鉴定及育种工作均有重要意义。以云南丽江主要栽培的19个油橄榄品种为试验材料,利用14个表型性状(5个叶片性状和9个果实性状)及20个SSR引物荧光标记进行多样性及聚类分析。结果表明,各品种油橄榄表型性状存在显著差异,20个SSR位点共检测到124个等位基因变异,平均每个位点等位基因数为6.2个,利用表型性状及SSR荧光分子标记可完...
基于SSR标记的不同优势等级云南松遗传多样性分析
优势等级 遗传多样性 云南松
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2019/5/27
基于SSR分子标记技术，按树高和胸径（地径）因子将样地内的植株分为优势木、中等木和劣势木3类，对不同生长优势等级云南松林木的遗传多样性变异特征进行了研究。结果表明：在林冠层，优势木的有效等位基因数、Shannon's信息指数、观测杂合度和期望杂合度分别为2.083、0.762、0.290和0.423，略高于中等木和劣势木；在更新层，有效等位基因数、Shannon's信息指数、观测杂合度和期望杂合度...
为鉴定EMS突变的真实性,本研究利用SSR标记和90 K SNP芯片对小麦品系H261及其EMS突变体进行检测。SSR检测结果表明,H261与LF2010和LF2099的差异SSR标记为0个,但与LF2100的差异SSR标记为10个,多态性比例为47.62%。SNP芯片分析结果表明,H261与LF2010和LF2099之间的差异位点分别为66和12个,分别占总数的0.080 9%和0.014 7%...