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紫金山天文台是国务院学位委员会授权的"天文学"一级学科和"天体物理","天体测量和天体力学"两个二级学科的博士、硕士学位授予点,并设有"天文学"博士后流动站。紫金山天文台是中科院首批进入知识创新工程试点的单位之一,共有十六个研究单元进入创新工程,其中十一个研究团组、一个研究中心、两个实验室和两个观测基地。

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