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肠道微生物伴随宿主进化并与动物胃肠道构成了复杂的微生态系统，参与宿主食物降解、营养吸收、免疫调节等重要生理活动，对宿主健康至关重要；同时，肠道微生物组成和功能受到宿主遗传背景、年龄、消化道不同部位等内在因素以及食物组成、地理环境、季节等外在因素的共同影响。高原鼢鼠（Eospalax baileyi）和甘肃鼢鼠（E. cansus）属于两种典型的地下啮齿类近缘物种，然而两物种间胃肠道微生物组成和多样...