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搜索结果: 1-15 共查到农学 叶绿体基因相关记录18条 . 查询时间(0.11 秒)
近日,广东省农业科学院环境园艺研究所特色花卉研究室在国际期刊Physiologia Plantarum(中科院2区,IF=5.081)发表题为“Diversity, classification, and EST-SSR-based association analysis of Caladium ornamental traits”的研究论文,广东省农业科学院环境园艺研究所周熠玮博士和叶远俊博士...
梓属(Catalpa)是紫葳科(Bignoniaceae)的重要物种,共有11~13个种,多为半常绿或落叶乔木,叶对生或轮生,其中楸、灰楸、滇楸、梓、藏楸原产于我国。楸树是我国传统栽培的优质珍贵用材树种,素有“木王”之美称。梓属由于表型和分子水平研究的缺乏以及序列信息的不足,无法清楚地揭示梓属种间的系统发育关系。
红木(Rosewood)是我国高端、名贵家具用材,红木可分为5属8类29种,其中黄檀属(Dalbergia)包含3类15种,具体为香枝木类(Scented rosewood)1种、黑酸枝木类(Black rosewood)7种、红酸枝木类(Siam rosewood)7种。随着人们生活水平的提高,对红木的消费需求急剧增加,但市场上主要通过人工判别不同品种,科学依据不足。构建黄檀属类红木树种的系统发...
武汉植物园东非植物区系与分类学科组的研究人员收集了球兰属及与其亲缘关系相近的眼树莲属多个物种的研究材料,利用基因组浅层测序技术测得了球兰属内同属球兰类群的31个物种的叶绿体基因组,并对其进行了多重分析以了解球兰类群内叶绿体基因组变异情况,从而确定一些新测序的中国特有物种的系统发育位置。研究人员还筛选了叶绿体基因组中的热点区域:trnT-trnL-trnF、 psba-trnH、trnG-UCC、n...
认知生物多样性的形成和维持机制即群落构建一直是生态学研究中的核心问题。系统发育群落生态学将系统发育分析方法整合到群落生态学的分析中,为探究群落生物多样性的演化与维持机制提供了新的视角。建立准确可靠的群落系统树是进行群落系统发育分析的前提和基础,分辨率较低的群落系统树可能导致对系统发育多样性指数的估计产生偏差,进而影响对特定群落的生态过程的推断。目前群落系统树的构建主要是利用Phylomatic、V...
为进一步推进对北京九龙山森林植物的研究与利用,近日,华林中心院优青项目团队在北京九龙山暖温带森林国家长期科研基地开展的九龙山植物叶绿体基因组研究取得进展。该基地依托于华林中心批复设立,基地内山区森林植被茂密、生物多样性和植被类型丰富多样,保存植物种类达400余种,是天然的森林植物种质资源保存库。
为进一步推进对北京九龙山森林植物的研究与利用,2021年11月17日,华林中心院优青项目团队在北京九龙山暖温带森林国家长期科研基地开展的九龙山植物叶绿体基因组研究取得进展。该基地依托于华林中心批复设立,基地内山区森林植被茂密、生物多样性和植被类型丰富多样,保存植物种类达400余种,是天然的森林植物种质资源保存库。
采用Illumina MiSeq测序平台对大花君子兰(Clivia miniata)叶片总DNA进行测序,通过组装获得了其叶绿体基因组(cpDNA)全长序列(158 114 bp)。对其cpDNA注释得到135个基因,包含87个蛋白编码基因、40个tRNA基因和8个rRNA基因。采用生物信息学方法对获得的cpDNA进行简单序列重复(SSR)分析和密码子偏好性分析。结果显示:①大花君子兰cpDNA中...
杜梨叶绿体基因组分析     杜梨  叶绿体基因组  CP-SSR       < 2020/7/8
利用高通量测序平台对杜梨(Pyrus betulaefolia)进行测序,并对其叶绿体基因组序列的结构特征进行分析。结果表明,杜梨叶绿体基因组与大多数高等植物一样,具有典型的环状双链四分体结构。其叶绿体基因组大小为160 058 bp,共检测到61 个SSR 位点(58 个单核苷酸重复和3 个二核苷酸重复)和56 个RNA 编辑位点,这些RNA 编辑位点均引起了氨基酸的变化。与砂梨(Pyrus ...
对威宁红花油茶(Camellia weiningensis)的叶片高通量测序数据进行叶绿体基因组的组装和注释分析。其叶绿体基因组长为156 490 bp,包含典型的四分体结构,序列已登录GenBank(MK820035)。叶绿体基因组比较分析表明,与其他山茶属物种一样,其结构与基因排序均保守,但在基因组的反向重复区边界处表现出明显区别。简单重复序列(SSR)分析表明,全基因组仅包含51个单核...
桑叶葡萄(Vitis ficifolia)是中国重要的葡萄属野生资源。以桑叶葡萄‘九里沟桑4号’为试验材料,利用Illumina HiSeq PE150测序平台完成了其全基因组重测序,并组装了其叶绿体基因组。注释结果表明,桑叶葡萄叶绿体基因组全长160 751 bp,呈典型的四分体结构,其大单拷贝区(large single copy,LSC)、反向重复序列(inverted repeat,IR)...
稻属AA型物种包含栽培稻和与其最近缘的野生稻物种,是稻属植物中一个重要的类群. 为了探究稻属AA型物种叶绿体基因组的适应性进化,以AA型稻属物种中已经公布的6个叶绿体基因组为对象,利用PAML和Selecton对叶绿体基因进行适应性进化的分析. 研究发现,4个基因(matK,ccsA,psbB和rpoC2)经历了正选择作用,并对基因的正选择位点进行了定位,初步分析了正选择位点的变异特点,探讨了正选...
采用高盐、低pH值法提取雷蒙德氏棉叶绿体DNA;通过物理剪切法获得随机断裂的DNA片段;剪切片段末端、补平修饰后与pCC1FOS载体连接;用噬菌体包装蛋白包装重组DNA,侵染大肠杆菌EPI300,构建了雷蒙德氏棉叶绿体基因组文库。对于叶绿体DNA剪切,以1 mL注射器中等速度吸打18次为最佳参数。叶绿体基因组Fosmid文库滴度为1×104 cfu·mL-1,插入片段大小平均为38 kb,最终筛选...
介绍了叶绿体基因工程的特点、叶绿体转化方法、转化中存在的问题及解决策略以及前景展望等, 重点阐述了叶绿体基因工程的研究新进展。
【目的】构建猪瘟病毒主要抗原E2基因在百脉根叶绿体基因组中定点转化载体,为百脉根叶绿体的转化及用叶绿体生产动物可直接食用疫苗奠定基础。【方法】通过用BLAST、DNAMAN等分子生物学分析软件对百脉根叶绿体基因组序列进行分析选定同源重组片段,采用PCR、分子克隆技术进行载体构建和鉴定。【结果】在百脉根叶绿体基因组中选择合适的外源基因整合位点,设计引物用PCR扩增叶绿体同源片段,将同源片段克隆后,构...

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