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为了深入了解引进溪红点鲑种质遗传结构状况,本研究利用溪红点鲑转录组数据设计四核苷酸重复微卫星引物1 018对,选择其中200对进行引物合成,经过筛选鉴定共获得111个特异性好且扩增效率高的微卫星标记,用其中27个多态性标记比较分析了溪红点鲑引进群体和养殖群体的遗传多样性。结果显示,27个微卫星位点在2个群体中共检测到171个等位基因,多态信息含量(PIC)为0.426 0~0.877 4,平均为0...
淮河安徽段日本沼虾野生群体遗传结构的微卫星分析
日本沼虾 淮河安徽段 微卫星 遗传结构
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2012/3/19
利用日本沼虾13对中高多态性的微卫星位点分析了淮河安徽段日本沼虾野生群体的遗传结构。结果表明:11个群体中共有118个位点经Bonferroni校正后显示杂合不足且显著偏离Hardy-Weinberg平衡;群体平均期望杂合度均小于0.658,显示出较低的遗传多样性水平,其中瓦埠湖、焦岗湖群体遗传多样性相对较高,高塘湖群体相对较低;淮河安徽段日本沼虾群体偏离了突变漂移平衡,呈现出遗传多样性下降的趋...
采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing Repeats)方法构建了仿刺参基因组富集CA微卫星序列的基因组短片段文库,筛选得到118条微卫星DNA序列。根据重复单元的排列特点,完美型共83个,占70.4%;非完美型共30个;占25.4%;复合型标记5个,占4.2%。选取其中20条微卫星序列设计引物进行多态性检测,并利用这20对引物对采...
棘头梅童鱼线粒体控制区的序列变异与群体遗传结构
棘头梅童鱼 群体遗传结构 线粒体控制区 序列
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2015/6/1
采用PCR扩增测序法获得了棘头梅童鱼Collichtys iucidus南通、启东、芦潮港、温州、瑞安、福州、番禺7个地理群体53尾鱼的mtDNA控制区全序列。棘头梅童鱼控制区序列长度为778~782 bp,序列长度变异主要是由位点的插入或缺失造成,识别了终止序列区TAS和保守序列区CSB1、CSB2、CSB3序列。共检测到多态位点66个,占全部序列的8.44%,检测到单倍型33种,平均单倍型多样...
魁蚶4个地理群体遗传结构的RAPD分析
魁蚶 遗传多样性 RAPD
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2015/5/28
应用RAPD标记技术对魁蚶 Scapharca broughtonii 1个韩国群体与3个中国群体的遗传多样性进行RAPD分析。对4个群体的133个个体进行扩增,共检测到171个位点。其中,多态性位点为167个,4个群体的多态性位点比例:韩国群体为86.55%、黄岛群体为90.06%、蓬莱群体为8596%和前三岛群体为8947%;4个群体的Shannon’s多样性指数为(0.460±0.232...
牙鲆4个选择性繁育后代群体遗传结构的微卫星分析
牙鲆 养殖群体 遗传多样性 微卫星分析
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2015/5/28
为了检测由3个牙鲆基础群体组合交配建立的4个选择性繁育后代群体的遗传多样性水平,本研究利用10对微卫星引物分析了其遗传结构信息。计算结果表明,等位基因数3~10个,平均等位基因数57个,有效等位基因数1357 1~4597 9,平均有效等位基因数2983 2,各个位点的平均观测杂合度0208 3~1000 0,平均期望杂合度0208 1~0795 6,多态信息含量0167 1~...