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相分离（phase separation）指溶液中生物大分子（蛋白，DNA以及RNA等）在适当的温度、pH及盐浓度下，达到一定浓度后形成浓相和稀相（或者多相）的过程。近年的研究表明相分离是驱动细胞内无膜细胞器形成的重要机制之一，并且参与调控基因转录、信号传导、染色质组装和蛋白质降解等重要生物学过程。蛋白质是细胞内相分离液滴的主要组分之一，近几年来越来越多的蛋白被证明可发生相分离，其相分离过程的属性...
BMC Biology | 李婷婷课题组基于深度学习预测E3泛素连接酶识别位点（图）
李婷婷课题组 北京大学基础医学院 蛋白酶
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2023/8/11
真核细胞内蛋白质的降解依赖于自噬及泛素-蛋白酶体系统（2004年诺贝尔化学奖）。其中，泛素-蛋白酶体系统负责降解细胞内超过80%的蛋白，该系统的关键酶为E3泛素连接酶，负责识别要被降解的底物蛋白并将其泛素化。人体内表达600余种E3，这些E3以特定规则结合不同底物蛋白，从而实现降解过程的特异性。底物上的E3识别位点被称为degron[1]，degron是长度5-8个氨基酸的短肽，通过disorde...