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2021年7月7日-8日,自然科学史研究所副研究员黄兴作为研究所代表,参加“2021年中国科学院科学实验展演汇演”,获得三等奖,自然科学史研究所获得“优秀组织奖”。
2014年11月24日,中国民族医药学会、中国民族医药协会共同主办的中国首届民族医药科学技术奖颁奖大会在重庆召开。民族医药科学技术奖分设自然科学奖、技术发明奖、科学技术进步奖、国际科学技术合作奖、民族医药产业创新奖、民族医药传承贡献奖6个奖项,旨在表彰民族医药科技领域做出突出贡献的集体和个人,调动广大民族医药科技工作者的积极性和创造性,促进民族医药事业的发展。
中国科学院自然科学史研究所2000——2002年度获奖成果一览。
中国科学院自然科学史研究所1995——1999年度获奖成果一览。
中国科学院自然科学史研究所1991——1995年度获奖成果一览。
中国科学院自然科学史研究所1980——1990年度获奖成果一览。
为贯彻实施《中华人民共和国科学技术普及法》和《全民科学素质行动计划纲要(2006—2010—2020)》,努力推出更多的科普精品,经国家科学技术奖励工作办公室批准,中国科普作家协会特设立“中国科普作家协会优秀科普作品奖”。中国科协常务副主席、书记处第一书记邓楠在中国科协七届五次全委会议讲话中要求,要通过评选表彰活动,把那些成就突出、贡献卓著、
中国科学院自然科学史研究所历年获奖成果一览。

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