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叶点霉属(Phyllosticta)真菌是常引起植物叶斑病,有时也能内生或腐生在植物组织中。该属真菌种类较多,分布广泛,寄生的植物种类也复杂。2023年来的研究表明,在叶点霉菌的识别鉴定中仅依赖于寄主信息和形态结构是远远不够的,因为很多物种常常具有相似的产孢细胞和分生孢子,并且寄主范围也不固定。因此,基于多基因的分子系统学(ITS, LSU,tef1,act和gapdh)在叶点霉病原菌鉴定是必不可...
中国林科院森林生态环境与自然保护研究所森环森保所在间座壳属的分子系统学研究中取得新进展(图)
森环森保所 间座壳属 分子系统学
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2023/3/20
间座壳属(Diaporthe)是植物上常见的病原菌种类之一,此外该属真菌也常是内生菌或者腐生菌。间座壳属病原菌可引发植物叶斑病、枝枯病、溃疡病以及果腐病等。传统的分类学依赖寄主和孢子特征来区分间座壳属内的物种,但是近年来的多项研究已经表明间座壳属真菌不具有寄主专一性。有的物种可以寄生很多种植物,而有时候多种间座壳会同时栖于同一种寄主植物上。因此,传统鉴定中造成了许多误定,亟需我们去修订完善。
中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所在椿启介菌科的分类学和分子系统学取得进展(图)
椿启介菌科 分类学 分子系统学
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2023/2/16
椿启介菌科(Tubakiaceae)是间作壳目(Diaporthales)分子系统发育树中独立起源的一支,椿启介菌具有独特的无性型特征,尤其是它们的分生孢子体—盾状分生孢子器(pycnothyria)。该科扩展自其模式属椿启介菌属(Tubakia),部分物种迁移至Apiognomonioides,Involutiscutellula,Oblongisporothyrium,Paratubakia,...
中国林业科学研究院森环森保所在椿启介菌属的分类学和分子系统学取得进展(图)
椿启介菌属 分类学 分子系统学
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2022/11/29
椿启介菌属(Tubakia)是壳斗科植物上常见的间作壳目真菌类群,能引起植物叶斑病和果腐病,或者作为叶片和果实的内生菌或腐生菌存在。在本研究之前,我国壳斗科植物上已经报道了6种椿启介菌,即栓皮栎上的T. americana,锥栗上的T. chinensis,栎属和栗属上的T. dryina,板栗上的T. japonica,沼生栎上的T. lushanensis,以及蒙古栎上的T. seoraksa...
椿启介菌属(Tubakia)是壳斗科植物上常见的间作壳目真菌类群,能引起植物叶斑病和果腐病,或者作为叶片和果实的内生菌或腐生菌存在。在本研究之前,我国壳斗科植物上已经报道了6种椿启介菌,即栓皮栎上的T. americana,锥栗上的T. chinensis,栎属和栗属上的T. dryina,板栗上的T. japonica,沼生栎上的T. lushanensis,以及蒙古栎上的T. seoraksa...
中国科学院海洋研究所合作在拟对虾属分子系统学研究中取得进展
中国科学院海洋研究所 虾 分子系统学
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2015/1/9
拟对虾属Parapenaeus属于甲壳动物十足目对虾科,是重要的经济种类。目前全世界已记录拟对虾属19种,是对虾科中较大的属,但拟对虾属包括的种下阶元最多(3亚种和2型)。80%的对虾类生活在热带和亚热带的浅海区(小于100m),而拟对虾属主要生活在外陆架和陆坡深水区(通常超过100m)。拟对虾属种在印度-西太平洋,东、西大西洋都有分布,而在东太平洋没有分布。由于深水种采集困难,其系统演化研究很少...
鞘翅目是世界上物种最丰富的类群,分为原鞘亚目(Archostemata Kolbe,1908)、藻食亚目(Myxophaga Crowson, 1955)、肉食亚目(Adephaga Schellenberg,1806)和多食亚目(Polyphaga Emery,1886)。随着分子生物学的发展,分子系统学的技术被广泛应用于鞘翅目系统学研究中。本文综述了鞘翅目高级阶元的分子系统学的研究进展及存在问...
灵长目疣猴亚科(Colobinae)物种是经历快速辐射进化和近期物种形成事件的典型类群,围绕其所包含的各属之间的系统发育关系一直是国内外研究的热点。
中国科学院昆明植物研究所蔷薇目分子系统学研究最新进展(图)
中国科学院昆明植物研究所 蔷薇目 分子系统学
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2011/10/19
蔷薇目作为被子植物共生固氮分支的一支,包括钩毛树科、大麻科、八瓣果科、胡颓子科、桑科、鼠李科、蔷薇科、榆科和荨麻科等9科,约261属,7725种。这些科形态差异很大,在以往的研究中,曾被不同的学者置于不同的目中。最近系统学研究结果虽然已经确定了蔷薇目的范畴,但其目下科间关系尚存在诸多争议。中国科学院昆明植物研究所张书东博士、李德铢研究员和伊廷双研究员,与美国佛罗里达大学的Douglas E. So...
在国家基金项目(No.30770138)的资助下,中国科学院昆明植物研究所伊廷双研究员带领项目组员对间断分布于北温带漆树科(Anacardiaceae)的清香木属(Pistacia)、盐肤木属(Rhus)和黄栌属(Cotinus),利用多个核基因和叶绿体基因片段开展了分子系统学和生物地理学研究。
中国科学院昆明动物研究所张亚平研究组在食肉目鼬科分子系统学方面取得新进展
中国科学院昆明动物研究所 张亚平研究组 食肉目 鼬科分子系统学
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2011/10/20
食肉目鼬科(Mustelidae)物种是经历快速辐射进化和近期物种形成事件的典型类群,围绕其所包含的各亚科之间的系统发育关系一直是国内外研究的热点,至今仍处于“众说纷纭”的状态。
基于COⅠ和Cyt b基因序列的凤蝶科六属分子系统学研究
凤蝶科 COⅠ基因 序列分析 分子系统学
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2011/12/28
对凤蝶科6属25种的COⅠ基因和20种Cyt b基因的部分序列进行测定和分析, 探讨它们之间的系统发育关系; 以茶小卷叶蛾Adoxophyes honmai为外群, 用邻接法(neighbor-joining, NJ)、 最大简约法(maximum parsimony, MP)和贝叶斯法(Bayesian inference, BI)重建了凤蝶科6属的分子系统树。结果表明: COⅠ基因部分序列长度...
中国科学院昆明动物研究所在食肉目分子系统学方面取得新进展
中国科学院 昆明动物研究所 食肉目科 核基因内含子
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2011/3/24
中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、云南大学于黎研究员和博士研究生栾鹏涛结合模式生物基因组信息,系统筛选获得了22个新的单拷贝核基因内含子片段,将它们用于食肉目科间系统发育关系研究。研究结果支持小熊猫是浣熊科和鼬科的姐妹群,不支持形态学研究将小熊猫归于浣熊科,或将大,小熊猫并为熊猫科的观点,也不支持线粒体基因组研究中认为小熊猫与臭鼬科或由浣熊科,鼬科和臭鼬科组成的进化枝关系最近。
中国科学院动物研究所在分子系统学基础研究方面取得进展
中国科学院动物研究所 分子系统学 基础研究 进展
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2011/10/17
在现代分子系统学研究中,最大似然法和贝叶斯分析是两种文献中最为主要的构建系统发育树的两种方法。在构建系统发育之前,研究人员一般都需要对比对后的多条基因序列进行最优进化模型选择。目前,通常使用的模型选择软件,如ModelTest等,其实包含似然比检验(LRT),赤池信息标准(AIC)和贝叶斯信息标准(BIC)等多种选择模型的统计标准。对于研究者来说,具体采用哪种统计标准最后选出进化模型往往是一个让人...