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2024年3月25日,中国科学院上海药物研究所陈小华课题组与谭敏佳课题组合作,在Nature Communications期刊发表题为“Spatiotemporal and direct capturing global substrates of lysine-modifying enzymes in living cells”的研究论文。在该项研究中,科研团队利用前期开发的PANAC光点击化学...
生命的核心存在着一种偏向,它的起源一直是个谜。今天几乎所有构成蛋白质的氨基酸都以镜像的形式存在,就像右手手套和左手手套。尽管这两种形式在地球早期应该是同样丰富的,并且可以很容易地在实验室中联系起来,但是生命只使用左旋。在原始汤里,一定有什么打破了平衡,使天平偏向了左旋,并从此保持了这种偏见。
叶绿体中的光合作用将光能转化为化学能,吸收二氧化碳,释放氧气,是地球生物圈的重要塑造者。叶绿体约在15亿年前通过蓝藻内共生进化而来。在进化过程中,叶绿体基因要么被废弃,要么逐渐转移到细胞核染色体中,导致多数陆地植物叶绿体基因组只保留了110-130个基因。其中,大部分基因编码基因转录、蛋白翻译和光合作用组分。叶绿体基因组保存着两种类型的RNA聚合酶,即细菌型质体编码的RNA聚合酶(PEP)和噬菌体...
本发明涉及一种骨髓蛋白质的制备方法及其应用,该方法中的原料为牛、羊、马、骆驼或其它动物屠宰场的动物骨骼里面的新鲜骨髓,采用水清洗前处理之后的新鲜骨髓中的蛋白质分别利用三羟甲基氨基甲烷盐酸缓冲溶液和氯化钠溶液提取,其中的脂质成分由石油醚或正己烷萃取其没有脂质成分残留,其后水提取物部分浓缩、透析脱盐、再利用现代喷雾干燥技术或冷冻干燥精制而成的骨髓蛋白质。该骨髓蛋白质被验证其抗细菌和真菌活性,具有广泛的...
本发明公开了一种蛋白质自相互作用的预测方法,该方法包括数据集的选择与建立,PSSM矩阵的生成,傅里叶描述子提取特征值,训练集和测试集的构建,分类器模型构建步骤完成,该方法是利用傅里叶描述子提取样本集的特征值,使计算机计算数据集的离散傅里叶变换所需的乘法次数大为减少,也节省了计算量;本发明能够利用随机投影的方法构建模型,大大提高了预测精度,能够得到比较好的预测效果;本发明方法计算代价低,功耗小;可以...
本发明涉及一种蚕茧丝胶蛋白质的超滤膜制备方法及其应用,该方法将剥取蚕茧表面丝状物,除去蚕茧内残留的杂志,剪成条状备用,加入石油醚脱脂,无水乙醇浸泡脱色,再利用碳酸钠水溶液煮沸,提取,超滤,合并滤液,离心,其上清液用采用截留分子量为30KDa的超滤膜,进行脱盐,其滞留溶液继续浓缩,并利用喷雾干燥或冷冻干燥得到精制优质丝胶蛋白质;通过SDS‑PAAG结果显示:提取的丝胶蛋白质含有分子量分布...
本发明涉及一种骨髓蛋白质和多肽的超滤膜制备方法及其应用,该方法以牛、羊、马、骆驼或其它动物屠宰场的动物骨骼里面的新鲜骨髓为原料,采用骨髓与骨头分类,清水清理、液氮冷冻粉粹得到骨髓粉,利用温水溶液提取,油脂成分充分脱脂,再利用现代超滤膜技术制备了截留分子量为10KDa的蛋白质,再利用现代喷雾干燥技术或冷冻干燥精制而成。该骨髓蛋白质被验证其抗细菌和真菌活性,不但是具有广泛的抗微生物活性,同时具有增强体...
即使在新冠疫情期间接种了数十亿剂疫苗后,信使核糖核酸(mRNA)疫苗仍令人惊讶。近日,《自然》发表的一项研究表明,mRNA疫苗可能会促使细胞产生少量意想不到的蛋白质。研究人员提出一种解决方案,有助于使未来基于mRNA的疫苗或药物更安全、更有效。
本发明涉及基于三维空间静电势重构的新型蛋白质粗粒化计算方法,包括以下步骤:首先计算不规则表面蛋白质表面离散点电荷的位置;然后将该离散点电荷进行优化并采用最小二乘法得到优化的点电荷的电量,得到蛋白质粗粒化的结果;根据优化后的点电荷的电量和位置生成蛋白质周围静电势,最后根据其与蛋白质周围原有的静电势之间的误差评判所得蛋白质粗粒化结果。本发明通过少数的点电荷对不规则表面蛋白质的表面进行离散,简化了蛋白质...
本发明涉及一种可保持蛋白质活性的软骨组织分级处理方法,通过切片处理,可以将软骨组织切成厚度为5-20μm的切片,在此过程中软骨组织中的细胞多数被切割破裂。再经反复冻融处理后,细胞结构均被破坏。将组织切片置于提取溶液中,搅拌超声处理。将组织片取出,获得的细胞类成分A。将取出的组织片再置于清洗溶液中,搅拌超声处理,彻底清除细胞类成分。将取出的组织切片置超纯水溶液中搅拌。将组织切片吸干水分后获得基质类成...
本发明涉及一种集成化蛋白质C-端富集方法,包括:选择性二甲基化标记、DL-甘油醛-3-磷酸标记、二氧化钛亲和去除。蛋白质样品的酶解产物首先在酸性条件下在反相捕集柱上进行选择性的N-端氨基二甲基化标记,然后采用DL-甘油醛-3-磷酸柱上标记肽段侧链氨基,最后采用TiO2材料亲和去除标记有磷酸根的肽段,从而得到蛋白C-端,中间无需进行样品转移、除盐冻干。本发明的优点是标记效率高、选择性高、处理步骤简单...
本发明涉及一种18O在线标记的蛋白质定量分析平台及其操作方法。18O在线标记的蛋白质定量分析平台是一种集蛋白质在线酶解,18O在线标记,多肽分离、检测于一体的系统,包括:注射泵,进样针,柱温箱,酶反应器,切换阀,肽段捕集柱,液相色谱泵,多肽分离柱以及质谱检测器。蛋白样品首先通过注射泵上样到酶反应器中进行孵育,在酶解的同时进行18O标记,酶解完成后18O标记的肽段经捕集柱在线富集后,转入多肽分离柱进...
2023年12月19日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分离分析新材料与新技术研究组(1809组)叶明亮研究员团队和空军军医大学聂勇战教授团队等合作,开发了一种位点特异性糖型的高稳健蛋白质组分析系统,对278例临床样本进行N-糖基化蛋白质组的规模化分析,筛选并验证了可诊断胃癌尤其是早期胃癌的新型蛋白质糖基化类生物标志物,为 N-糖基化蛋白质组的规模化分析提供了一种分析工具。
本发明公开了一种基于混合隶属度随机块模型的蛋白质相互作用预测方法和系统,该系统由数据处理模块、复合物隶属度计算模块和结果生成模块组成,基于随机块的蛋白质相互作用预测方法,从数据库中获取蛋白质相互作用数据,对获得的数据进行处理;应用随机变分推理对蛋白质相互作用网络进行分析,计算复合物隶属度指标;基于复合物隶属度指标的计算结果,对蛋白质相互作用进行预测,展示预测结果。该系统通过混合隶属度随机块模型以及...
蛋白质磷酸化是在激酶催化下将磷酸基团转移到底物蛋白质上的可逆过程,是一种能调控蛋白质结构与功能并参与细胞内信号转导的重要翻译后修饰,在植物的生长、发育、环境适应以及作物的产量和品质调控中发挥着重要的作用。深度解析磷酸化蛋白质组是理解磷酸化如何参与这些生物学过程以及筛选与作物重要农艺性状相关的关键磷酸化靶点的有效手段。然而,与动物相比,植物磷酸化蛋白质组的深度解析在技术上更具挑战性。因为植物细胞具有...

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