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鸡mtDNA D-loop区单倍型簇频率与中国家鸡多母系起源研究
家鸡 mtDNA D-loop区 单倍型 聚类分析 频率 起源
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2016/12/26
本研究旨在通过分析家鸡和原鸡D-loop区单倍型簇的区域性分布和频率揭示中国家鸡多母系起源的区域和传播途径。通过对1 347条鸡D-loop序列进行完全对比排序，共发现198种单倍型，聚成12个单倍型簇。分析结果显示，海岛型红色原鸡与家鸡和大陆型红色原鸡有明显差异；苏门答腊大陆型红色原鸡作为独立分支，也体现出与东南亚大陆型红色原鸡的区别。单倍型簇频率分析显示，Clade C代表的母系可能更早在东南...
旨在探讨鸡16号染色体SNP单倍型和拷贝数变异（Copy number variation，CNV）对血清IgG含量的影响。采用鸡60 K SNP芯片对995只北京油鸡进行分型，同时测定80日龄IgG含量。分别采用PennCNV、Haploview 4.1和PHASE 2.0软件对拷贝数变异、连锁不平衡、单倍型分析及与IgG的关联分析。结果发现，该区域存在2个单倍型块和2个拷贝数变异区。Block...
外显子16是鸡lmbr1基因最大的外显子，本研究进行了该外显子在丝羽乌骨鸡和白洛克肉鸡间的SNP检测和单倍型分析。研究表明，鸡lmbr1 外显子16 的PCR-SSCP基因型在两个品种间的分布存在明显差异，测序从24个个体中检测到4个变异位点，其中T32C变异在两个品种间存在明显差异，丝羽乌骨鸡均含有32T（纯合的TT或杂合的TC），白洛克肉鸡在T32C位点都为纯合的CC；单倍型分析从24个个体中...
为探讨中国美利奴羊（新疆军垦型）不同单倍型个体感染细粒棘球绦虫的免疫应答变化。将8只抗性单倍型绵羊设为抗性组，8只非抗性单倍型绵羊设为对照组，在相同的饲养条件下进行人工感染攻虫。分别在攻虫前7 d（－7 d）、攻虫当天（0 d）、攻虫后第7、21、30、60 天用流式细胞仪分析外周血中CD4+ T、CD8+ T、B淋巴细胞亚群的变化，同时用ELISA方法定量分析血清中IgG、IgM、IgE、IFN...