搜索结果: 1-7 共查到“生物学 参考基因”相关记录7条 . 查询时间(0.452 秒)
牛油果T2T参考基因组组装助力脂肪酸生物合成和抗病性相关基因鉴定（图）
牛油果 基因组 脂肪酸 抗病性 Horticulture Research
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2024/5/10
牛油果(Persea americana Mill.)属樟科鳄梨属常绿乔木，为著名的热带水果之一，原产于中美洲，果实富含多种不饱和脂肪酸，口感细腻，香气独特。为了深入理解牛油果的遗传信息，中国科学院西双版纳热带植物园（以下简称“版纳植物园”）植物基因组演化与次生代谢研究组，利用NGS、PacBio HiFi、ONT、Pore-C等测序技术对西印度品种的牛油果进行了全基因组测序，并成功组...
不同参考基因组对RAD-seq分析中SNP Calling的影响（图）
Plant Science 基因组 RAD-seq
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2024/5/11
中国科学院西双版纳热带植物园（以下简称“版纳植物园”）植物系统发育与多样性保护研究组选取黄杞（Engelhardia roxburghiana）为研究物种，利用生物信息学软件STACKS，探索使用不同参考基因组对SNP Calling的影响。该研究围绕两种不同参考基因组：使用近缘种（即枫杨：Pterocarya stenoptera）作为参考基因组，以及利用物种本种（即黄杞）作为参考基...
中国科学院华南植物园等发布首个三倍体栽培香蕉T2T参考基因组（图）
三倍体 栽培香蕉 T2T参考基因组
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2023/8/21
香蕉是产量颇高的水果，也是热带、亚热带地区的主要粮食作物之一。栽培香蕉起源复杂，基因组杂合度高、分型困难，导致香蕉的基因组研究相对落后于其他栽培作物。三倍体香蕉是全球栽培香蕉的主力军，其中Cavendish香蕉（AAA）因易于运输而被大量栽种，其产量约占据香蕉市场的50%。Cavendish香蕉高质量分型基因组的组装和注释将有助于探究栽培香蕉的起源和驯化历史，为香蕉种质资源的遗传评价和种质创新奠定...
拟南芥高质量参考基因组Col-PEK发布（图）
拟南芥 基因组 Col-PEK 汪颖 Molecular Plant
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2023/3/19
为了给植物学科研工作者提供一个更好的参考基因组，中国科学院大学生科院汪颖团队和中科院遗传发育所/北京大学生科院焦雨铃团队合作，结合长读ONT、高保真的长读PacBio HiFi和短读Illumina NovaSeq测序数据获得了接近完整的拟南芥Col-0生态型的参考基因组Col-PEK。Col-PEK组装填补了包括五个着丝粒在内各区域中的绝大多数缺口。例如，Science发布的Col-CEN中5号...
近日，Cell Press旗下交叉学科期刊iScience在线发表了陕西省西安植物园、陕西省“三秦学者”李思锋团队有关漆树的研究论文，公开发布染色体级别的漆树参考基因组序列，及揭示漆树木质素及漆酚合成相关的代谢通路。
研究发布拟南芥高质量参考基因组（图）
拟南芥 参考基因组 模式植物
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2022/9/15
拟南芥（Arabidopsis thaliana）作为被广泛应用的模式植物，其基因组序列加快了植物分子生物学研究。在首个基因组发布二十余年后，仍存在大量未填补的缺口区域。在常用的TAIR10/Araport11版本的基因组序列中，存在165个缺口。这些缺失区域可能由高度重复的序列组成，包括端粒、着丝粒、5S rDNA簇和含有45S rDNA的核仁组织区（NORs）。近年来，ONT和PacBio等长...
中国科学院水生生物研究所发布高质量AB品系斑马鱼参考基因组并揭示不同斑马鱼品系间的序列差异（图）
中国科学院水生生物研究所 斑马鱼 AB品系 基因组 序列差异 Molecular Ecology Resources
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2022/4/24
斑马鱼（Danio Rerio）是生命科学、健康科学和环境科学等研究领域的重要模式生物之一。常见的两种实验室斑马鱼品系分别是Tubingen品系和AB品系。其中，AB品系斑马鱼被国内外很多实验室作为研究对象。然而，却缺乏一个高质量的AB品系斑马鱼参考基因组。由于不同品系斑马鱼来源不同，各品系之间存在着大量基因序列上的差异，其中包括一些可能对表型产生重大影响的结构变异。因此，相比于通用的Tubing...