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随着单细胞测序技术的快速发展,多个全球性的、大规模的细胞图谱项目相继启动,例如人类细胞图谱计划等。然而,把来自于不同组织、不同发育阶段或者只有很少重叠细胞类型的单细胞转录组数据集进行准确有效的整合仍然具有非常大的挑战性。因为当前整合单细胞数据的方法需要校正批次效应从而达到整合分析的目的,而上述所涉及的数据集的批次信息不清晰,利用这些方法常常会导致校正过度或者校正不足等问题,从而影响研究结论的准确性...
胃癌全球范围内致死率排名第三,患者通常只有不到40%的五年生存率。其中约10%的胃癌与EB病毒(EBV)相关。相比于EBV阴性胃癌,EBV阳性胃癌(EBV associated gastric carcinomas,EBVaGCs)具有独特的分子特征,包括PIK3CA高频突变、CDKN2A表达缺失、高甲基化,以及9p24.1扩增等,表明EBV在EBVaGCs的肿瘤发生过程中可能扮演着重要角色。有研...
北京大学生物医学前沿创新中心汤富酬课题组开发出单细胞基因组单分子测序新方法(图)
北京大学生物医学前沿创新中心 汤富酬 单细胞 基因组 单分子测序
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2021/7/12
单细胞全基因组测序技术(scWGS)可以有效揭示生物样品中不同细胞之间的异质性,并系统鉴定单个细胞的基因组中发生的遗传变化,例如拷贝数变异(CNV)和点突变(单核苷酸变异,SNV)等。过去十年,研究人员已经开发出多种单细胞基因组扩增技术,例如简并寡核苷酸引物PCR扩增技术(DOP-PCR)、多重置换扩增技术(MDA)、多重退火和基于环的扩增循环技术(MALBAC),以及通过转座子插入和体外转录进行...
2020年12月18—19日,北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)十周年庆典暨2020年度学术研讨会在秋林报告厅举行。中国科学技术协会名誉主席、北京大学前沿交叉学科研究院院长、北京大学科学技术与医学史创系主任韩启德院士,北京大学校长郝平、副校长张平文,王恩哥院士,北京市教委主任刘宇辉,王晓东院士,邵峰院士,乔杰院士,林东昕院士,北京大学生命科学学院院长吴虹、分子医学研究所所长肖瑞平,清华大...
北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)揭牌(图)
北京大学 生物医学 前沿创新中心 揭牌
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2018/12/17
2018年12月10日上午9时,北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)揭牌仪式暨2018年度中心学术研讨会在中关新园1号楼群英厅举行。北京大学校长郝平、副校长龚旗煌,南开大学校长曹雪涛,北大相关职能部门人以及BIOPIC主任谢晓亮、BIOPIC师生和媒体代表等200余人共同见证BIOPIC揭牌仪式。揭牌仪式由BIOPIC常务副主任苏晓东主持。郝平指出,自2010年建立以来,BIOPIC研究人...
北京大学生物医学前沿创新中心BIOPIC白凡课题组揭示调控细菌耐药和复苏的关键分子机制(图)
北京大学生物医学前沿创新中心 BIOPIC 白凡 课题组 细菌耐药 复苏 关键分子机制
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2018/11/27
2018年11月21日,国际著名学术期刊Cell子刊Molecular Cell以长文形式在线发表了北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)白凡研究员课题组关于细菌耐药机制的重要研究成果。在题为“ATP-dependent dynamic protein aggregation regulates bacterial dormancy depth critical for antibiotic...