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“芯片上心脏病”模型可复制心肌梗塞
芯片 心脏病 心肌梗塞 胆固醇
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2023/5/26
美国南加州大学生物医学工程系研究人员开发了一种“芯片上心脏病”模型，该设备有朝一日可作为开发新的心脏病药物甚至个性化药物的试验平台。研究成果发表在最近的《科学进展》杂志上。
特定基因突变可能会导致肿瘤细胞产生特殊行为，例如超强耐药性等。在活细胞内、单细胞水平上探索基因突变与活细胞行为相关性能够为临床治疗提供更加精准可靠的参考。
胃癌基因芯片测序与异常基因差异表达
胃癌 可变剪接 基因差异表达 基因芯片
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2021/2/24
通过对胃癌样本基因的富集分析，探索其中 RNA 可变剪接的变化情况及相关分子机制。方法 回顾性收集中国人民解放军总医院的 3 例胃癌患者的癌组织及其癌旁组织的病理样本，进行蛋白定量标记、基因芯片检测、高通量测序等以获取数据；通过 DAVID 等网络软件对样本做 GO 富集和 KEGG 通路分析，得出筛选出的基因的差异可变剪接相关信息。
通过生物信息学的方法分析无/轻度肺气肿与严重肺气肿患者的差异基因。从基因表达数据库（GEO）下载无/轻度肺气肿与严重肺气肿患者的肺组织芯片数据GSE1650，通过t检验获得差异基因。然后使用DAVID数据库对差异表达基因进行基因本体（GO）及京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。再利用STRING数据库对差异表达基因进行蛋白相互作用网络（PPI）分析，并选出关键基因。
研究 c-Met 基因下调后对结直肠癌侵袭和转移的影响机制。方法 在 SW480 细胞中敲低 c-Met 基因，通过基因芯片筛选差异基因，对差异基因进行功能聚类分析，通过 IPA 分析细胞信号通路和相关的差异基因相互作用网络以及相关基因与上游调控分子间的作用关系。选取被抑制的信号通路中的相关基因进行 qPCR 验证。
骨肉瘤基因表达谱芯片的生物信息学分析
骨肉瘤 分子机制 差异表达基因 生物信息学
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2020/8/27
探讨骨肉瘤（OS）基因表达和生物学过程的改变，为OS分子机制的进一步研究提供生物信息学依据。［方法］ 从GEO数据库（gene expression omnibus）下载Sadikovic B等构建的OS样本的基因芯片数据集，应用生物信息学方法筛选差异表达基因（differentially expressed genes，DEGs），并利用R语言clusterProfiler软件包对差异基因进行基...
建立风湿性关节炎（RA）及其RA湿热瘀阻证的血清多肽质谱分类模型，为RA的临床诊断提供依据。方法60例RA患者根据证型分为湿热瘀阻证（30例）及非湿热瘀阻证（30例），30名健康体检者为健康对照组。分别以RA患者与健康对照组相比较、RA湿热瘀阻证患者与非湿热瘀阻证患者相比较，收集患者血清标本，以磁珠法分离血清多肽后，进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱进行分析。通过ClinProt Tools软件...
应用生物信息学方法研究闭塞性细支气管炎移植物中间充质干细胞与肺源性间充质干细胞的差异基因表达。方法 从基因表达数据库 (GEO)在线数据库中下载并分析获得的闭塞性细支气管炎和胎肺肺组织中间充质干细胞明显表达差异的233个基因。对差异基因进行功能富集并分析蛋白质与蛋白质间相互作用关系。
探讨基因芯片法与线性探针法检测痰标本中结核分枝杆菌（MTB）的应用价值。方法 海南医学院第二附属医院2018年3-7月门诊和住院的106例疑似肺结核患者纳入研究，采用基因芯片法、线性探针法对患者送检的痰进行检测，并与改良罗氏培养法进行比较；以比例法药敏试验为金标准，分析上述两种方法检测利福平和异烟肼耐药性的效能。
“芯片肺”的研究进展
芯片肺 仿生肺 呼吸系统疾病
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2020/6/24
“芯片肺”是近年来一种在微流控芯片上利用微加工技术制造出具有部分生理功能的仿生肺三维模型。未来该模型可能代替动物实验,在体外模拟呼吸系统疾病的发育过程,并对呼吸系统疾病的研究和药物筛选具有重要意义。本文就 “芯片肺”的结构及当前在呼吸疾病研究中的应用进展作一综述。
探讨基因芯片检测技术对分枝杆菌菌种鉴定和结核分枝杆菌耐药性检测的临床应用价值。方法 收集云南省传染病专科医院2012年9月至2017年12月收治的患者阳性培养标本及抗酸染色阳性标本378例，用基因芯片检测系统分别进行分枝杆菌菌种鉴定、结核分枝杆菌的利福平和异烟肼耐药性检测。
利用组织芯片分析DJ-1蛋白在非霍奇淋巴瘤组织中的定位表达及意义
非霍奇金淋巴瘤 组织芯片 DJ-1蛋白表达
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2018/9/21
DJ-1是PARK7基因编码的一种蛋白质,其过表达与许多恶性肿瘤的发生、侵袭、转移及预后密切相关。然而,有关DJ-1蛋白在非霍奇金淋巴瘤(NHL)中的表达与NHL生物学特性的关系尚未见文献报导。本文检测了61例NHL组织中DJ-1蛋白在细胞核内外的表达情况,发现DJ-1蛋白在细胞浆内高表达的情况较细胞核内更为显著( 93.4%、72.1%),且都显著高于非肿瘤组织(28.6%、14.3%)。此外,...