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CBF/DREB转录因子属于AP2 (APETALA2)转录因子家族, 能够识别下游COR (cold-regulated)基因启动子上的CRT/DRE顺式作用元件。在低温等非生物胁迫条件下, CBF (C-repeat binding factor)转录因子通过结合在CRT/DRE元件上激活COR基因的表达, 从而提高植物抗逆能力。另外, CBF转录因子也会影响植物的生长和发育。本文从CBF转录...
以‘早巨峰’葡萄为试材, 利用20 mmol·L-1 NaCl通过根部浇灌对葡萄进行长期处理, 能提高果实Na+、Cl-含量, 显著下降K+含量。品质分析表明, 长期低盐处理显著降低了果皮花青素含量; 轻微降低了果肉TSS含量, 显著降低了葡萄糖和果糖含量; 相比之下, 可滴定酸、酒石酸和苹果酸在转色前后对盐处理具有不同的响应。长期低盐处理显著降低了果实ABA含量。转录组分析表明, 长期...
近日，中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所巫永睿研究组的研究成果，以The maize imprinted gene Floury3 encodes a PLATZ protein required for tRNA and 5S rRNA transcription through interaction with RNA polymerase III为题发表在The Plant ...
植物次生细胞壁加厚过程的转录调控
维管束 次生细胞壁 转录因子 调控网络
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2018/12/10
双子叶植物次生木质部中的导管和管胞、单子叶植物初生木质部的导管对于植物体的水分运输至关重要。厚壁组织对植物的机械强度起到主要的支撑作用, 其中双子叶植物是由皮层的厚角组织和维管束提供, 单子叶植物由机械组织和维管束提供。这些行使特殊功能的组织细胞都能发生次生细胞壁加厚, 加厚的细胞类型有管状细胞、纤维细胞、厚壁细胞等。次生细胞壁合成是一个复杂的生物学过程, 本文围绕次生细胞壁加厚发生的主要组织——...
利用转录组学方法揭示南荻群体遗传
转录组学 南荻群体遗传 南荻
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2017/9/4
南荻是中国特有的亩产生物量最大的芒属能源植物。南荻原产于河滨地带，但其遗传变异丰富，生态适应强，移栽到黄土高原等半干旱地区后，生长良好；由于其根系较浅，种植后不会过度利用深层土壤水分，可以有效减少地表径流，有助于水土保持，发挥重要的生态修复功能。近日，中国科学院武汉植物园闫娟博士在李建强和桑涛研究员的指导下，根据以往对南荻生理生态及群体遗传的研究，揭示利用转录组学方法研究群体遗传，可以捕获群体内和...
茶树HD-Zip转录因子基因的克隆及其对非生物胁迫的响应分析
茶树 HD-Zip转录因子 基因克隆 非生物胁迫 表达分析
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2018/12/11
茶树作为一种叶用植物, 具有重要的经济价值。非生物胁迫对茶树的生长发育过程和茶叶的生产影响很大。本研究采用RT-PCR方法从茶树‘龙井43’ cDNA中克隆获得1个编码HD-Zip转录因子的基因CsHB1。序列分析显示, CsHB1基因cDNA长为1 380 bp, 编码459个氨基酸, 含有典型的START结构域。进化分析显示, 茶树CsHB1属于HD-Zip家族转录因子的IV亚族。多序列对比发...
NAC蛋白是植物中最大的转录因子家族之一, 在生长发育、衰老以及逆境应答等多个生物学过程中起重要作用。本文简要综述了NAC转录因子在植物对生物和非生物胁迫反应应答中的功能及其机制。
中国科学院武汉植物园在淫羊藿类黄酮合成途径的转录调控研究中取得进展（图）
中国科学院武汉植物园 淫羊藿 类黄酮 合成途径
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2017/7/21
中国科学院武汉植物园副研究员黄文俊在研究员王瑛的指导下，在淫羊藿药用植物中类黄酮合成途径的转录调控中取得新进展。研究人员从箭叶淫羊藿中分离鉴定了一个新的R2R3-MYB转录因子EsMYB9，它极可能参与花青素和黄酮醇两个合成途径的调控。研究表明EsMYB9与VvMYB5a、VvMYB5b调控基因同属一个进化枝，并且与它们有着相似的功能。EsMYB9在烟草中的超量表达可有效提高花组织中花青素和黄酮醇...
苹果抗寒矮化砧应答冷胁迫的转录因子基因鉴定
苹果 抗寒矮化砧 冷胁迫 转录因子
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2018/12/13
利用RNA-seq鉴定抗寒苹果矮化砧木‘71-3-150’冷胁迫(4°C)响应过程中的转录因子。结果表明: 该砧木冷胁迫2、6、12和24 h时的样品与未处理相比, 差异表达的转录因子基因数分别为83、98、115和136, 共计228个, 表明大量转录因子参与该砧木的冷胁迫响应。这些转录因子基因属于32个家族, 占苹果转录因子总数的7.25%, 包括32个WRKY、30个AP2/ERF、28个b...
转录调控是生物体内由转录因子和其他调节蛋白协同或拮抗地调控基因表达的重要生化机制。光信号是高等植物早期生长发育中光形态建成的决定性因素，其信号通路中光敏色素互作因子PIF为负向调控因子，HY5为正向调控因子。PIF和HY5分别是bHLH型和bZIP型转录因子，在植物生长发育及环境响应中具有广泛的功能，然而二者之间的相互调节仍不甚清楚。
基于RNA-Seq技术苹果基因结构优化与新转录本预测
苹果 RNA-Seq 基因结构优化 新转录本预测
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2018/12/13
苹果(Malus domestica)已经完成全基因组测序并公布全基因组图谱, 但是基因注释信息很不完善, 因此本试验利用RNA-Seq技术对苹果已注释基因结构进行优化和新转录本预测。以‘富士’花后15、30、45、60 d的果肉为材料提取总RNA, 构建文库并使用Illumina双末端测序HiSeq 2500平台进行测序, 获得高质量的序列(clean reads)。将得到的结果与苹果‘金冠’参...
从小桐子(Jatropha curcas)幼苗的叶片组织中分离出一个新的AP2/ERF类转录因子的编码基因, 命名为JcERF3。序列分析显示其完整编码区为729 bp, 编码蛋白由242个氨基酸组成。推测的蛋白质与其他物种的ERF3蛋白具有很高的序列相似性, 并含有一个保守的AP2结构域。对启动子元件的预测显示存在一个乙烯响应元件(ERE), 暗示JcERF3的表达可能受到乙烯的调节。核定位信号...
脱落酸(ABA)在植物的生长发育中起着重要的作用, ABI5是响应ABA信号的关键基因, 研究调控ABI5基因表达的转录因子对进一步阐述ABA信号转导及调控具有重要意义。本研究中, 将3-AF1、Box I和Sp1三次重复串联后连接到pAbAi诱饵质粒上, 转化酵母细胞构建诱饵载体, 构建桃(Prunus persica)酵母单杂交cDNA文库, 再共转化诱饵菌株, 经同源重组筛选PpABI5启动...
通过转录组测序技术鉴别普通油茶(Camellia oleifera) EST-SSR位点, 开发筛选适用于普通油茶种质资源评价与利用的多态性SSR标记, 对普通油茶的遗传变异研究和油茶良种的分子标记辅助育种具有重要意义。利用 MISA 工具从普通油茶转录组67 434条Unigenes (63.39 MB)中筛选得到26 751个包含1~6个核苷酸重复类型的SSR位点, SSR的分布频率为39.6...
北京大学生命科学学院苏晓东实验室揭示茉莉酸信号通路中转录因子调控新机制（图）
北京大学生命科学学院 苏晓东实验室 茉莉酸 信号通路 转录因子 植物 生长发育
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2017/5/18
2017年5月16日，北京大学生命科学学院苏晓东实验室在Cell子刊Cell Reports杂志上发表题为“Crystal Structure of tetrameric Arabidopsis MYC2 reveals the mechanism of enhanced interaction with DNA”的研究论文，文章解析了植物中首个basic Helix-loop-Helix（bHL...