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西北农林科技大学生命科学学院郁飞教授科研团队在叶绿体RNA聚合酶PEP复合体组装方面取得新进展
叶绿体 RNA聚合酶 PEP复合体 光合作用
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2023/10/18
光合作用基因表达调控对叶绿体发育和光合作用具有重要意义。叶绿体基因组编码基因由细胞核基因组编码的RNA聚合酶(Nuclear-encoded RNA polymerase, NEP)和叶绿体基因组编码RNA聚合酶(Plastid-encoded RNA polymerase, PEP) 转录。高等植物叶绿体RNA聚合酶PEP的核心亚基组成与结构与原核生物类似，但是在进化过程中，陆生植物P...
Mol Plant｜南昌大学王东团队和中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风团队揭示了长链非编码RNA DANA2调控植物干旱应答的分子机制（图）
Mol Plant 南昌大学 王东 中国科学院 曹晓风 长链非编码 植物干旱
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2023/10/11
2023年8月7日，Molecular Plant在线发表了南昌大学王东教授团队和中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风院士团队题为“The long non-coding RNA DANA2 positively regulates drought tolerance by recruiting ERF84 to promote JMJ29-mediated histone demethylat...
中国科学院植物研究所研究人员在长链非编码RNA调节植物抗冻特性研究中取得重要进展（图）
长链非编码 RNA 植物抗冻 低温胁迫
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2023/9/19
中国科学院植物研究所张文浩研究组的研究发现，苜蓿CBF/DREB1s基因间长链非编码RNA MtCIR2能够在常温下诱导CBF/DREB1s表达，增加植物的抗冻性。在常温下生长的MtCIR2超表达株系中，CBF/DREB1s表达大幅度增加，其抗冻性也显著高于野生型。MtCIR2缺失突变体中，CBF/DREB1s表达量显著降低，对低温冷冻胁迫极其敏感。该研究还发现，MtCIR2通过调节糖代谢，影响细...
南方科技大学生命科学学院杜嘉木课题组合作在Science发表关于植物小RNA的突破性研究成果（图）
南方科技大学生命科学学院 杜嘉木课题组 Science 植物 小RNA 基因调控
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2022/10/20
近日，南方科技大学生命科学学院教授杜嘉木课题组联合美国加州大学洛杉矶分校教授Steven Jacobsen课题组以及深圳大学医学院教授李思思课题组在植物小RNA领域的研究中取得突破进展，相关成果以“Mechanism of siRNA production by a plant Dicer-RNA complex in dicing competent conformation”为题在线发表在国际...
研究发现RNA介导DNA甲基化参与调控草莓成熟（图）
RNA介导 DNA甲基化 草莓成熟
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2019/1/12
2018年12月4日，Genome Biology 期刊在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组和植生生态所张一婧研究组合作完成的题为Downregulation of RdDM during strawberry fruit ripening 的研究论文，该研究揭示了RNA介导DNA甲基化通路在草莓果实成熟过程中的调控作用。DNA胞嘧...
通过构建藏红花开花前2 d与开花日两个不同时期柱头的小RNA文库并进行高通量测序, 分别获得3 711 809和2 303 043条序列。借助生物信息学的方法, 共鉴定出164条保守的miRNA。其中, 随开花过程下调表达和上调表达的miRNA分别是71和46条。靶基因预测及功能富集分析显示它们可能参与了硫辛酸生物合成、细胞程序性凋亡、花粉细胞的分化、脱落酸介导的信号途径等生物过程。本文筛选的藏红...
小RNA调节植物免疫应答反应研究进展
植物小RNA RNA干扰 免疫应答 病原物侵染
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2018/11/23
植物小RNA不仅参与调控植物生长发育, 而且在调节植物免疫应答方面具有重要作用。根据其起源和前体结构的不同, 可以分为微小RNA (miRNA)、小干扰RNA (siRNA)等, 其在植物体内合成方式与作用机制方面存在差异。病原物侵染会引起内源性小RNA或病原物来源的小RNA表达变化, 进而引发植物免疫应答反应并激活相应的RNA干扰路径。本文重点介绍了小RNA类型以及合成方式, 植物对病原物的免疫...
基于RNA-Seq技术苹果基因结构优化与新转录本预测
苹果 RNA-Seq 基因结构优化 新转录本预测
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2018/12/13
苹果(Malus domestica)已经完成全基因组测序并公布全基因组图谱, 但是基因注释信息很不完善, 因此本试验利用RNA-Seq技术对苹果已注释基因结构进行优化和新转录本预测。以‘富士’花后15、30、45、60 d的果肉为材料提取总RNA, 构建文库并使用Illumina双末端测序HiSeq 2500平台进行测序, 获得高质量的序列(clean reads)。将得到的结果与苹果‘金冠’参...
本文以前期获得的银叶真藓在干旱-复水过程中的转录组数据为基础, 选择了9个在干旱-复水条件下基因表达差异明显的相关耐干响应基因, 并利用荧光定量PCR技术研究其在干旱-复水、ABA诱导胁迫及盐胁迫下的表达模式。研究结果表明, RT-qPCR实验获得的9个基因在干旱-复水下的表达趋势与RNA-Seq基因表达谱中基因表达规律基本一致, 因此较好地验证了RNA-Seq数据的可靠性。在干旱-复水过程中, ...
中国科学院上海生命科学研究院发现小分子RNA靶基因介导植物抗热途径新机制（图）
生命科学 小分子 RNA靶基因介导 植物抗热
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2014/4/15
2014年4月11日，中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所何玉科研究组在Plant Cell 杂志上在线发表题为HEAT-INDUCED TAS1 TARGET1 Mediates Thermotolerance via HEAT STRESS TRANSCRIPTION FACTOR A1a–Directed Pathways in Arabidopsis 的研究论文。该研究探索了一类...
从Science杂志将“Small RNA & RNAi ”评为2002年度最耀眼的明星，到2005年MicroRNA的研究第五次入选“十大科技突破”，再到2006年度美国人安德鲁·法尔和克雷格·梅洛因RNA干扰机制研究的杰出贡献而获得诺贝尔生理学或医学奖， MicroRNA已成为当今生物学研究的热点之一。植物MicroRNA通过对靶基因转录后的调控广泛参与植物的生长发育和胁迫应答，分析植物M...