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出血性大肠杆菌(Enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)O157: H7是一种危害严重的食源性致病菌,能引发腹泻、出血性结肠炎,以及溶血性尿毒综合症等。该病原菌的宿主是以牛为主的反刍动物,可随宿主粪便排放到环境中,通过食物、水感染人类。面对EHEC O157: H7的感染,尚缺乏有效的治疗方案,给宿主接种疫苗则能较好地预防相关疾病暴发。迄今为止,只有两种牛用...
近年来,随着测序技术和算法的开发,大量动植物基因组被陆续测序和组装,但是基因组组装质量参差不齐,存在不同程度的组装错误,影响了后续的相关研究。高质量的参考基因组对于基因的精准注释和功能研究以及比较基因组学和调控元件的挖掘等至关重要。虽然目前已经有一些基因组组装质量评估的方法,然而它们大多数仅提供了一个概述性的评估值,没有能够针对特定区域设置特定碱基给出精准度的评估。
水稻、玉米和小麦是三大主粮作物,但主粮来源单一成为粮食安全和营养安全的隐患,因此对“孤儿作物”(orphan crop)的重视利用是应对粮食安全危机的有效手段之一。然而,随着城乡现代化进程的持续推进和现代集约化农业的快速发展,“孤儿作物”野生种和地方品种资源正日趋减少,与主粮作物相比,其种质资源的研究及现代育种技术的应用滞后。菱角是典型的“孤儿作物”。新石器时代以来,长江流域的先民开始有意识地大规...
水产品为人类食物蛋白的第三大来源,近20年来世界水产品特别是养殖规模快速增长,其中养殖产量近2/3来自于中国。随着水产养殖的快速发展,养殖水环境持续恶化,“禁抗令”实施后养殖投入持续增长,等等一系列问题已成为制约水产养殖健康持续发展的主要瓶颈。因此,水产替抗功能植物的研究势在必行。作为水产上可引起鱼体抗病力下降和生长受阻的一个重要诱因,饲料引起的鱼类食源性的肠肝病变,也需进行植物功能成分添加的预防...
2023年来,由于热带传染病登革热的盛行,对热带地区群众的生命健康造成了极大威胁。然而目前用于大面积喷洒以趋避和杀灭蚊虫的化工合成药品对人体和环境均存在二次伤害的风险,因此人们对能够有效驱避埃及伊蚊的天然绿色驱蚊产品的需求已迫在眉睫。
近年来,热带传染病登革热盛行,对热带地区群众的生命健康造成威胁。然而,目前用于大面积喷洒以趋避和杀灭蚊虫的化工合成药品对人体和环境均存在二次伤害的风险,因而亟需发展能够有效驱避埃及伊蚊的天然绿色驱蚊产品。
2023年9月21日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心林鸿宣研究组和上海交通大学林尤舜研究组联合,在《分子植物》(Molecular Plant)上,在线发表了题为植物热应激反应的分子基础的综述论文。该文章总结了植物在热形态建成和热胁迫损伤过程中感知和响应温度的分子机制,并从“源-库”角度提出了在全球气候变暖的形势下减少作物产量损失的应对策略。阐明植物对高温反应的基本机制,挖掘优异的耐高温基因位...
植物单细胞的研究领域近年来迎来了飞速发展,为我们深入了解植物生长、发育和适应环境的奥秘提供了全新的机会。深入揭示植物细胞的异质性和功能多样性,不仅有助于我们理解植物生长和适应不同环境的分子机制,还为优化农业生产和改善植物抗病性提供新的理论依据。然而,植物单细胞大数据分析、处理、比较和挖掘等方面的挑战也需要创新的方法和工具来应对。最近,我院陈迪俊课题组在植物单细胞大数据平台开发和基因调控网络解析方面...
2023年9月7日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心斌团队联合中国水稻研究所杨仕华、龚俊义研究组,收集了2839份杂交水稻种质资源。这些资源覆盖了整个中国杂交水稻育种历史,也是迄今为止已报道的最大规模杂交稻种质资源集。其中,18份代表性杂交稻材料被挑选用于构建包含万份个体的F2群体。基于这些材料的基因型和表型数据,该研究从在时间维度上评价了过去半个世纪的杂交育种成就,鉴定改良育种的分子印迹,量化...
2023年8月30日,中国科学院微生物研究所林啸研究团队、英国塞恩斯伯里实验室(The Sainsbury Laboratory)Jonathan D.G. Jones团队、中国农科院农业基因组研究所黄三文团队和韩国首尔大学Kee Hoon Sohn团队合作,在Nature Genetics杂志发表题为“Solanum americanum genome-assisted discovery of...
小麦是世界三大粮食作物之一,穗部性状是决定小麦产量的关键因素,增加籽粒同化物的分配对提高小麦产量具有重要的影响。籽粒和其他穗部结构(穗糠)之间遗传关系是决定籽粒同化物分配的重要因素。然而,同化物在小麦籽粒和其他穗部结构(穗糠)之间分配的遗传分子机理还没有被充分解析。因此鉴定同化物在小麦籽粒和穗糠之间分配的调控因子,解析相关分子机理对提高小麦产量具有重要的意义。
中国科学院微生物研究所专利:一种受ABA调控的miRNA在提高植物抗旱性中的应用
中国科学院微生物研究所专利:OsMKK6蛋白及编码基因在调控植物种子发育中的应用
中国科学院微生物研究所专利:一种人工合成的植物抗虫蛋白及其制备方法和应用
香蕉是产量颇高的水果,也是热带、亚热带地区的主要粮食作物之一。栽培香蕉起源复杂,基因组杂合度高、分型困难,导致香蕉的基因组研究相对落后于其他栽培作物。三倍体香蕉是全球栽培香蕉的主力军,其中Cavendish香蕉(AAA)因易于运输而被大量栽种,其产量约占据香蕉市场的50%。Cavendish香蕉高质量分型基因组的组装和注释将有助于探究栽培香蕉的起源和驯化历史,为香蕉种质资源的遗传评价和种质创新奠定...

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