搜索结果: 1-9 共查到“水产学基础学科 相关基因”相关记录9条 . 查询时间(0.283 秒)
转录组测序筛选克氏原螯虾卵巢发育、免疫和生长相关基因
克氏原螯虾 转录组测序 差异表达基因 功能注释
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2020/12/18
为发掘克氏原螯虾卵巢发育、免疫和肌肉生长的重要功能基因,采用Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台对克氏原螯虾的卵巢、肝胰腺和肌肉组织进行了转录组测序。所得序列经质控、组装后比对到NR、Swiss-Prot、pfam、COG、GO和KEGG数据库中注释,并进行差异基因聚类分析。结果显示,测序共获得了53 006个unigene,平均长度为1 194 bp。对3个组织样品的测序文库...
为开发与草鱼生长性状相关的基因以及单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记,本研究采用转录组测序技术(RNA sequencing,RNA-Seq)对草鱼快长组和慢长组的肝脏、肌肉和脑组织分别进行分析,共获得31 465万条高质量短读序(clean reads),经组装得到34 147条拼接基因(unigene),平均长度为1 060 bp,其中有...
多倍化现象常见于植物、动物和真菌中,其在物种演化过程中起着重要作用。多倍化过程中常出现的“转录组震荡”,被认为在物种演化的重要因素。多倍化过程中细胞周期调控研究是了解多倍化过程的重要方向。本研究以mRNA-seq技术来探究二倍体红鲫和四倍体异源四倍体鲫鲤中体外(培养细胞)和体内(鳍和肝组织)条件下mRNA的差异表达情况。比较体外和体内环境下的基因表达情况,发现二倍体中7482个基因(36.0%)存...
大菱鲆脂质代谢相关基因PPARs的组织表达及其对高温胁迫的响应
大菱鲆 脂质代谢 过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARs) 基因表达 高温胁迫
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2020/11/24
为研究大菱鲆过氧化物酶体增殖物激活受体家族(PPARs)的组织分布和高温胁迫下PPARs在肾脏中的表达情况。实验采用荧光定量PCR(qPCR)技术检测PPARs基因3种亚型在大菱鲆不同组织中的表达情况以及高温胁迫下大菱鲆肾脏中PPARs的表达情况。qPCR结果显示,大菱鲆PPARs 3种亚型的组织分布存在显著差异。PPARα1和PPARα2在心脏中的表达量显著高于其他组织;PPARβ在大菱鲆的各个...
条斑紫菜单孢子形成相关基因(PyMFG)的特性及其表达差异
条斑紫菜 RNA-Seq 单孢子 PyMFG TEA-ATTS超家族 qRT-PCR
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2020/5/18
以条斑紫菜转录组测序筛选得到的差异性表达基因(Contig-21827)序列为基础,采用RT-PCR技术克隆得到了条斑紫菜单孢子形成相关基因PyMFG的完整开放阅读框。对其进行序列分析发现,PyMFG基因的ORF全长为1 224 bp,编码一个包含407个氨基酸的多肽片段,其分子量为46.24 ku,等电点为9.08。结构域分析结果显示,该蛋白含有保守的TEA结构域和YAP结构域,属于TEA-AT...
外泌体是具有磷脂双分子膜结构的纳米级囊泡,能够参与机体多种生理过程。实验探讨了草鱼肝细胞外泌体的分离鉴定方法,并初步研究外泌体对草鱼肝细胞中miRNAs及免疫相关基因表达的影响。实验以草鱼肝细胞L8824为材料,通过超速离心获得外泌体,利用电子显微镜观察外泌体形态,采用纳米颗粒示踪分析(nanoparticle tracking analysis,NTA)技术检测外泌体粒径和数量,同时利用West...
基于转录组测序技术筛选花䱻卵巢发育相关基因
花䱻 卵巢发育 转录组
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2020/1/20
为筛选影响花䱻卵巢发育相关的基因,采用Illumina Hiseq技术对花䱻脑、卵巢和肝脏组织进行高通量转录组测序。结果显示,3个组织分别产生了49 484 132、47 540 538和50 622 304个clean reads,组装后共获得了99 878个unigenes,平均长度为1 430 bp。DE seq分析发现,在脑vs.卵巢组中特异性表达的基因数为2 ...
为了研究饲料中添加茶多酚对大菱鲆生长、抗氧化能力及脂肪代谢相关基因表达的影响,以初始体质量为(13.51+0.31) g的大菱鲆幼鱼为实验对象,设计4组添加不同梯度茶多酚(0%、0.01%、0.02%和0.05%,干重添加量分别为0、100、200和500 mg/kg)的等氮等脂实验饲料,进行为期70 d的摄食生长实验。结果显示:①与对照组相比,饲料中添加0.01%~0.02%茶多酚显著提高了大菱...