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牛油果(Persea americana Mill.)属樟科鳄梨属常绿乔木,为著名的热带水果之一,原产于中美洲,果实富含多种不饱和脂肪酸,口感细腻,香气独特。为了深入理解牛油果的遗传信息,中国科学院西双版纳热带植物园(以下简称“版纳植物园”)植物基因组演化与次生代谢研究组,利用NGS、PacBio HiFi、ONT、Pore-C等测序技术对西印度品种的牛油果进行了全基因组测序,并成功组...
中国科学院西双版纳热带植物园(以下简称“版纳植物园”)植物系统发育与多样性保护研究组选取黄杞(Engelhardia roxburghiana)为研究物种,利用生物信息学软件STACKS,探索使用不同参考基因组对SNP Calling的影响。该研究围绕两种不同参考基因组:使用近缘种(即枫杨:Pterocarya stenoptera)作为参考基因组,以及利用物种本种(即黄杞)作为参考基...
2024年3月29日,由中国科学院动物研究所(以下简称“动物研究所”)牵头承担的国家重点研发计划“典型脆弱生态系统保护与修复”重点专项“国家重点保护动物基因组多样性评估与遗传拯救技术”项目启动暨实施方案论证会在北京召开。
基因扩增又称无细胞分子克隆系统或特异性 DNA 序列体外引物定向酶促扩增法,是基因扩增技术的一次重大革新。可将极微量的靶DNA 特异地扩增上百万倍,从而大大提高对 DNA 分子的分析和检测能力,能检测单分子 DNA 或对每 10 万个细胞中仅含 1 个靶 DNA 分子的样品,因而此方法立即在分子生物学、微生物学、医学及遗传学等多领域广泛应用和迅速发展。由于 PCR 具有敏感性高、特异性强、快速、简...
寄生植物是通过特化器官吸器(haustorium)从寄主植物中获取养分和无机盐,这个习性在被子植物中至少独立演化了12次。旋花科菟丝子属(Cuscuta L.)是全球广布的寄生植物代表,已记载超过200个种。在形态上,菟丝子属植物属于茎寄生,根和叶片已完全退化,光合作用能力非常微弱或者完全失去。菟丝子属质体基因丢失和基因组功能退化已被多次报道,但其基因基因组功能退化和演化规律尚未明晰...
反刍动物中包含许多重要的家畜,它们拥有独特的包含多个胃室的消化系统。目前对于反刍动物胃肠道中细菌、古细菌的研究已取得了显著进展。而病毒同样是反刍动物胃肠道微生物群的关键组成部分,在塑造微生物组成方面发挥重要作用,并且由于病毒的微生物宿主范围狭窄的特性可以作为一种精确调控微生物宿主以抑制病原细菌和控制甲烷排放的系统性工具。然而对于反刍动物胃肠道中的病毒群落生态结构仍然缺乏全面的了解。2024年4月4...
近日,陕西省西安植物园资源植物功能基因挖掘与应用团队受邀在植物科学领域Top期刊Trends in Plant Science(IF=20.5)发表了题为“Spatial multi-omics in medicinal plants: from biosynthesis pathways to industrial applications”的Forum论文,探讨了空间多组学技术的应用对进一步阐...
2024年3月15日,动物科学学院李占军教授团队在Science子刊《Science Advances》期刊发表了题为“Precise large-fragment deletions in mammalian cells and mice generated by dCas9-controlled CRISPR/Cas3”的研究成果。该研究证明了dCas9可用于精确调控Type I-E介导的DN...
东南亚是全球生物多样性最为丰富的地区之一,该地经历了中新世以来复杂的地质气候变迁,其生物多样性演化历史备受生物地理学研究的关注。兰科兰属(Cymbidium Sw.)是东南亚的代表类群,主要分布在中国西南山地至东南亚群岛,延伸可分布至澳大利亚东北部,约60余种。其中,兰属中的春兰、建兰、寒兰等地生兰被称为“国兰”,具有非常高的经济和观赏价值。由于早期研究取样比例低或基因序列信息位点不足...
利用组学、遗传学和微生物学方法,以纤毛虫原生动物、细菌、酵母等为研究模式,研究生物多样性的产生与演变机制,聚焦生物的突变规律和生活史演化,具体研究主题如下:A.生活史在高变环境下的演化规律与机制;B.基因组演化以及稳定性机制;C.环境胁迫下的突变形成;D.医疗及环境水体中病原微生物演化;E.水产养殖病害纤毛虫的生物防治。
2023年2月29日,国家自然科学基金委员会发布了2023年度中国科学十大进展。中国科学院动物研究所成果“揭示人类基因组暗物质驱动衰老的机制”入选。人类基因组是生命活动的“密码本”,它控制器官再生和机体稳态,亦影响器官退行及衰老相关疾病的发生。在该密码本中,素有“暗物质”之称的非编码序列约占98%,其中约8%为内源性逆转录病毒元件,为数百万年前古病毒整合到人类基因组中的遗迹。古病毒序列在衰老过程中...
近日,中国科学院水生生物研究所缪炜研究员与华中科技大学宁康教授团队合作解析了青藏高原水生微生物基因组和基因目录。研究搜集了来自青藏高原湿地、淡水湖、盐水湖、河流、温泉和冰川的498个水体环境DNA样本并进行了宏基因组测序,初步建立了一个青藏高原水生微生物基因组和基因目录(Tibetan Plateau Microbial Catalog, TPMC)。TPMC目前包含了3万多个中高质量的原核微生物...
近期,华中科技大学宁康教授团队与中科院水生所缪炜教授团队搜集了来自青藏高原盐水湖、淡水湖、河流、温泉、湿地以及冰川的498个水体样本并进行了宏基因组测序,建立了一个全面的青藏高原水生微生物组的基因组和基因目录(Tibetan Plateau Microbial Catalog,TPMC)。TPMC中包含着32 355个中高质量的宏基因组组装的基因组(Metagenome-assembled gen...
为了进一步促进国内和国际学者在三维基因组领域的交流与合作、展示三维基因组领域的最新研究成果,我们拟于2024年11月1日至3日在美丽的海南省三亚市举办"第十一届国际三维基因组学研讨会"。本次研讨会将邀请国内外著名专家,就三维基因组学的最新进展做大会专题报告,共同探讨三维基因组学研究中采取的技术、未来研究内容和发展方向。本次大会的主题是"3D genome for better life,三维基因组...
2024年1月16日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员周小龙、王恩多团队在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上,发表了题为Multifaceted roles of t6A biogenesis in efficiency and fidelity of mitochondrial gene expression的研究成果。该工作揭示了人线粒体转移核糖核酸(tRN...

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