搜索结果: 16-30 共查到“兽医科学基础学科 基因组”相关记录68条 . 查询时间(0.327 秒)
大白猪基因组选择在不同应用策略下的比较研究
基因组选择 预测可靠性 育种策略 种猪
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2021/3/11
目前，基因组选择（genomic selection，GS）技术已经在种猪育种中开展，但为获得较高的收益，还需研究一些应用策略，如确定仔猪基因分型个体比例和早期仔猪留种比例。本试验选择温氏集团出生于2011—2016年的大白种猪作为研究对象，共有超过4.5万条的生长测定记录，超过7万条繁殖记录，和2 090个个体的简化基因组测序（GBS）数据，其中，出生于2016年7~12月的440个体作为候选群...
梅花鹿与欧洲马鹿染色体水平基因组的比较研究
梅花鹿 欧洲马鹿 染色体水平基因组 比较基因组学
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2021/3/5
旨在从基因组层面揭示梅花鹿与欧洲马鹿的起源进化，找到与进化过程相关的信号通路并与表型进行关联。本试验以成年雌性梅花鹿与成年雄性欧洲马鹿染色体水平基因组作为研究对象，利用比较基因组学的方法对梅花鹿和欧洲马鹿基因组进行染色体共线性分析，获得两个物种间基因组序列的同源关系和基因组发生的染色体倒位现象，并对被倒位截断和在倒位内部未被截断的两类基因分别进行GO和KEGG功能富集分析；同时对两个物种染色体上的...
利用猪1.4M高密度SNP芯片检测巴马香猪全基因组拷贝数变异
巴马香猪 拷贝数变异 1.4M高密度SNP芯片
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2021/3/11
旨在检测巴马香猪基因组上的拷贝数变异（CNV），并探究标记密度对于CNV检测效率和准确率的影响。本研究利用319头巴马香猪（其中阉公猪160头和母猪159头）1.4M高密度SNP芯片的数据，采用PennCNV和R-Gada两种软件进行CNVs检测；然后通过重叠CNV融合法，构建拷贝数变异区域（CNVR），并用全基因组关联分析（GWAS）对频率大于5%的CNVR进行验证；最后根据不同的标记密度，均匀...
鸡血糖性状的全基因组关联分析
血糖 鸡 全基因组重测序 SNP 全基因组关联分析(GWAS) 分子标记
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2020/7/9
旨在挖掘影响鸡血糖性状的有效SNP位点及功能基因，为优质肉鸡分子育种工作提供有效的理论支撑。本试验选取407只京星黄母鸡于98日龄屠宰，酚仿法提取血液DNA，进行深度为10×的全基因组重测序；葡萄糖氧化酶法测定血清中血糖水平，基于全基因组重测序和血糖表型数据进行全基因组关联分析（GWAS）。结果，GWAS共筛选到6个血糖相关的SNPs位点（关联阈值P < 1.43×10-6）。基因注释发现，rs7...
中国农业大学动物科技学院杨宁教授团队在联合分析宿主基因组与肠道微生物对鸡腹脂沉积的贡献方面取得重要进展（图）
中国农业大学动物科技学院 杨宁 教授 宿主基因组 肠道微生物 鸡腹脂沉积
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2019/2/28
肠道微生物对维持宿主健康和提升动物生产性能发挥着重要作用，但其相对贡献很难度量，特别是存在宿主自身遗传效应的前提之下。近日，微生物学领域顶尖期刊The ISME Journal(五年IF=11.663，Nature指数期刊)在线发表了我校动物科技学院杨宁教授团队题为“The gut microbiota is largely independent of host genetics in regu...
“动物基因组和基因功能研究”团队取得“活性物质根皮素改善内皮细胞氧化应激及相应抗氧化机制”研究新进展（图）
动物基因组 基因功能研究 活性物质 根皮素改善 内皮细胞 氧化应激 抗氧化机制
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2019/1/28
近日，Journal of Agricultural and Food Chemistry杂志（中科院农林科学一区；中科院TOP期刊）在线发表了我院陈宏教授“动物基因组和基因功能研究”团队题为“Activation of Nrf2 by phloretin attenuates palmitic acid-induced endothelial cell oxidative stress via ...
不同性别大白猪肌肉全基因组高分辨率单碱基甲基化差异分析
性别 肌肉 全基因组 甲基化
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2019/1/16
旨在通过不同性别大白猪的全基因组高分辨率单碱基甲基化差异分析，检测差异甲基化区域（DMR）和差异甲基化基因（DMG），为进一步解析公母猪骨骼肌发育差异奠定基础。本研究采用全基因组重亚硫酸盐测序（WGBS）技术分析了4头210日龄长白猪（公、母各半）背最长肌全基因组DNA的甲基化程度和差异甲基化区域，探讨性别间DNA甲基化水平的差异。结果表明，全基因组范围约有5%的胞嘧啶（C）发生了甲基化（mC）；...
旨在筛选具有高自然转化效率的副猪嗜血杆菌（HPS）菌株，为自然转化机制及基因功能研究提供生物材料；对所得菌株进行全基因组测序，通过比较基因组分析，挖掘HPS自然转化发生的分子背景。本研究采用自然转化方法对75株HPS田间分离株及15株标准株进行自然感受态菌株的筛选，并测定各自然感受态菌株的转化效率。采用PacBio三代测序技术对具有高自然转化效率的HPS菌株SC1401进行全基因组测序，对测序数据...
肉鸡肌肉与脂肪组织基因组差异剪接基因分析
肉鸡 可变剪接 差异剪接基因 RNA-seq
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2019/1/16
旨在鉴定和分析肉鸡肌肉和脂肪组织基因组差异剪接基因（differential splicing gene，DSG）。本研究采用Illumina Hiseq 2500测序平台对AA肉鸡胸肌和腹部脂肪组织各3个样品进行转录组测序，使用rMATS软件检测样品中可变剪接事件（alternative splicing，AS）和组织间的DSG，并对DSG进行GO功能富集和KEGG通路分析。结果表明，在肉鸡肌肉...
旨在探讨GBLUP与惩罚类回归方法用于猪血液性状基因组选择的相关问题。以本实验室收集的免疫资源猪群体13个血液性状为分析对象，结合Illumina公司猪SNP60K基因芯片分型数据，以加性模型和加性-显性模型为基础，利用GBLUP和3种惩罚类回归方法（ridge、lasso与elastic-net）开展基因组选择分析。研究发现，基因组选择的准确性与性状芯片遗传力估计值呈正相关。交叉验证分析结果表明...
中国农业科学院特产研究所首次破译鹿科动物全基因组序列（图）
中国农业科学院特产研究所 鹿科动物 全基因组序列
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2017/11/8
近日，由中国农业科学院特产研究所李光玉研究员带领创新团队在国际上首次破译鹿科动物全基因组序列。驯鹿全基因组测序的完成，不仅为研究人员从基因组水平挖掘驯鹿生长、代谢和抗寒等重要性状的分子机制提供了科学指导，而且为驯鹿驯化历史、基因组演化、群体遗传及鹿类动物的进化等理论研究奠定了重要基础。相关研究成果于11月1日在线发表在《GigaScience》上。
基于显性模型的基因组选择中贝叶斯方法研究
全基因组选择 贝叶斯模型 显性效应 显性系数
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2017/3/14
本研究旨在探索显性效应对基因组育种值估计准确性的影响。基于贝叶斯A模型，根据加性效应和显性效应相关性，提出两种子模型：1）加性效应和显性效应相互独立的BayesAD1模型；2）显性系数（Dominant coefficients）与加性效应的绝对值相互独立，并且显性系数服从正态分布的BayesAD2模型。通过模拟数据比较加性效应模型BayesAD0和两种显性效应模型下基因组估计育种值（GEBV）的...
近日，中国农业科学院兰州兽医研究所家畜寄生虫病创新团队在寄生虫基因组研究方面又取得重要突破，成功解析了牛带绦虫和亚洲带绦虫基因组。相关研究成果在线发表于最新一期的国际著名学术期刊《自然-通讯（Nature Communications）》（http://www.nature.com/articles/ncomms12845）。牛带绦虫和亚洲带绦虫可引起人类带绦虫病（Taeniasis）及家畜囊尾蚴...
不同尾型绵羊全基因组选择信号检测
全基因组 选择信号 候选基因 脂肪沉积
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2015/12/2
为研究不同尾型绵羊群体遗传分化程度，检测全基因组选择信号，以挖掘不同尾型绵羊重要性状相关的候选基因。本研究基于蒙古羊（短脂尾）和藏羊（瘦尾）群体的Illumina Ovine SNP 50K芯片分型数据，借助遗传分化系数FST法进行群体间选择信号检测，寻找选择信号区域内的重要基因，并对其中与脂肪代谢相关的基因PPARG、PDGFD在呼伦贝尔羊（大尾和小尾品系；肥尾）与藏羊（瘦尾）尾脂进行mRNA相...
根据863计划管理办法的有关要求，2015年5月11.12日，863计划现代农业领域办组织有关主题专家对东北农业大学承担的863计划“鸡重要经济性状的功能基因组学研究”和北京奶牛中心承担的863计划“奶牛重要经济性状的功能基因组学研究”课题进行了中期现场检查。科技部农村中心赵红光副主任，农村司以及农村中心相关工作人员、部分主题专家参加了现场检查。