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高通量与高内涵筛选方法》
单细胞多组学技术已成为生命科学的有力工具,但一个精准、低损伤、广谱适用、简捷的目标表型单细胞获取手段,是靶向性单细胞基因组、转录组、蛋白质组或代谢物组分析的先决条件。近日,青岛能源所单细胞中心发明了光镊辅助静态池成像分选技术(OPSI),能“所见即所得”、保持细胞原位活性、高通量地分选明场、荧光、拉曼成像下的目标单细胞,支撑高质量的单细胞基因组/转录组测序。该技术对于细菌、古菌、真菌、动植物、人体...
2021年12月10日,清华大学医学院生物医学工程系刘鹏研究员课题组联合北京航空大学陈晓芳副教授课题组在学术期刊Nucleic Acids Research上在线发表题为Grouped-seq for integrated phenotypic and transcriptomic screening of patient-derived tumor organoids的研究论文,报道了能够高通量...
2021年6月23日,上海交通大学医学院附属仁济医院上海市肿瘤研究所覃文新团队在《自然综述•胃肠病学和肝病学》杂志(Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology)发表长篇述评,全面总结了CRISPR-Cas9功能基因筛选技术在肝癌中的研究进展,阐述了当前利用该技术在探索肝癌发生发展和耐药机制以及开发治疗新靶点新策略等方面的进展,同时对肝癌研究...
2021年6月23日,上海交通大学医学院附属仁济医院上海市肿瘤研究所覃文新团队在Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology发表题为Exploring Liver Cancer Biology through Functional Genetic Screens的长篇述评[1]。述评全面总结了CRISPR-Cas9功能基因筛选技术在肝癌中的研究进展,阐述...
二代测序(NGS)又称为大规模平行测序,能够同时对上百万甚至数十亿个DNA分子进行测序,从而实现大规模高通量测序的目标,目前在肿瘤临床诊疗实践中NGS主要应用于驱动基因测序,是肿瘤精准诊疗的重要环节。国家药品监督管理局日前批准总部位于美国加州圣地亚哥的因美纳研发的基于NGS的NextSeq 550Dx基因测序仪正式在中国上市,用于临床人源样本的人类DNA检测诊断,首台NextSeq 550Dx已在...
研究二甲双胍对糖尿病小鼠肠道菌群的影响。方法 SPF级 ICR雄性小鼠9只,体质量22 g左右,随机选3只作为对照组(BMCK、M2WCK和M42CK),其余6只高糖高脂饮食饲养4周后腹腔注射四氧嘧啶溶液引发胰岛损伤后完成糖尿病小鼠造模。6只糖尿病小鼠随机均分为二甲双胍治疗组(BMMet、M2WMet和M42Met)和模型组(BMMod、M2WMod和M42Mod)各 3只。二甲双胍治疗组给予每日...
探讨高通量测序技术(next generation sequencing,NGS)在甲状腺乳头状癌(papillary thyroid cancer,PTC)相关的15个靶基因变异检测中的应用价值。方法?收集2019年1月至2020年6月就诊的188例PTC患者手术切除的癌组织石蜡包埋标本,采用NGS技术检测其中15个目标基因;利用GATK 4.0.2.0、VarScan.v2.3.9和 Fact...
探讨加速康复外科(ERAS)管理流程对结直肠癌患者肠道菌群的影响。方法 采用便利抽样方法纳入 2018 年 8 月至 2019 年 12 月期间四川大学华西医院胃肠外科收治的结直肠癌患者为研究对象,被随机分为 ERAS 组和传统组,其中 ERAS 组患者围术期管理依据 ERAS 流程进行,传统组按照传统流程进行围术期临床管理。于入院 24 h 内、术后第 1 次自然排便时分别采集研究对象的新鲜粪便...
人类病原菌及其引发的相关疾病严重威胁公众健康,因此,亟需发展高灵敏性、高特异性的诊断工具对这些病原菌进行监测并对其污染来源进行追溯对保护人类健康是具有重大意义。然而,目前对人类病原菌进行监测的一个主要挑战是同时定量多个病原菌的丰度,这对综合评估微生物污染水平以及进行健康风险评估是十分必要的;另一个主要挑战则是鉴定微生物污染来源,这对于环境管理者采取相关措施减缓或控制环境污染是至关重要的。
近几年来,孕晚期阴道菌群变化对母婴的影响方面一直是各临床工作者关注的重点问题。通过传统培养方法和非培养方法,现已证实妊娠晚期阴道菌群变化与母婴不良妊娠结局存在相关性,但对于妊娠晚期阴道菌群结构变化的认识尚存在局限性。本文主要根据近年阴道菌群方面的研究进展,探讨第二代高通量测序技术对妊娠晚期阴道菌群变化研究的应用前景,以期为孕妇孕期阴道微生态异常的早期识别、治疗等提供新的理论依据和方法。
探讨孕妇外周血胎儿游离DNA 无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)技术在评估胎儿染色体非整倍体风险中的临床应用价值。方法 选取2018 年4 月~ 2019 年10 月于徐州市妇幼保健院进行NIPT 检测的8 001 例孕妇,提取其静脉血血浆中胎儿游离DNA,利用高通量基因测序平台进行测序分析,高风险者进行羊膜腔穿刺术及染色体核型分析进行确诊诊断,低...
由中科普瑞昇公司和中国科学院合肥物质科学研究院联合科技攻关团队,利用细胞工程技术以及分子生物学相关技术,紧急开发了以荧光素酶报告体系为基础的针对新冠病毒3C蛋白酶的药物高通量检测细胞体系。该体系应用了蛋白复性的原理,能够在48小时内同时对几千个药物进行快速筛选和精准评价。
近日,我所微流控芯片研究组(1807组)秦建华研究员团队在实现功能类器官可控负载与培育研究方面取得新进展,建立了一种基于双水相液滴微流控系统的杂合水凝胶微囊可控制备新体系,可高通量产生干细胞来源胰岛类器官,并利于降低其变异性。
美国一研究团队开发出一种新方法,可以高通量制备用于四聚体分析的探针库,以对血样中的T细胞库进行大规模分析评估。这一方法有助于推动免疫学研究、癌症免疫疗法开发以及对病毒感染者免疫反应的评估。在当下对抗疫情过程中,则有望在新冠肺炎免疫反应研究中发挥作用。相关研究论文20日发表在《自然·通讯》杂志上。众所周知,T细胞在免疫系统中起着核心作用,与抗体形成互补,但T细胞的测定却比抗体测试要难很多。一种被称为...

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