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近日，The Crop Journal在线发表了福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心邓祖湖研究员团队题为 “Sequence analysis of Erianthus arundinaceus chromosome 1 isolated by flow sorting after genomic in situ hybridization in suspension”的研究论...
高通量测序技术对早熟棉中miRNA的鉴定与分析
棉花 miRNA 高通量测序 早熟
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2023/10/18
棉花中miRNA的数量仍较少,miRNA在棉花早熟发育中的作用有待证明和揭示。为丰富棉花中miRNA的数量,同时,为揭示miRNA在早熟棉发育中的作用,以早熟棉花品种石早1和中熟棉花品种冀棉958为材料,利用高通量测序技术构建了2个小RNA文库,鉴定新的miRNA,比较早熟棉花和中熟棉花中miRNA表达的差异、特点。结果共鉴定到131个miRNA,包括41个不同家族的64个已知miRNA和67个新...
外源DNA片段的拷贝数及插入位点的侧翼序列等分子特征信息是转基因植物安全评价过程中必需要提供的信息。本研究利用基因组测序结合生物信息学对耐除草剂转基因水稻G2-7的T-DNA插入位点、拷贝数和侧翼序列进行鉴定。利用Illumina NovaSeq 6000平台对G2-7进行全基因组测序, 共获得47.13 Gb的测序数据, 通过与转基因载体和参考基因组序列的比较, 确定了G2-7中T-DNA在受体...
2019年2月15日，我校严建兵教授团队在NatureCommunications杂志上发表了题为Single Gametophyte Sequencing Reveals that Crossover Events Differbetween Sexes in Maize的论文。该研究开发了玉米单个雌配子体的分离方法，并扩增测序了其基因组。结合之前同一个遗传材料已发表的单个小孢子基因组数据，利用...
利用高通量测序技术鉴定棉纤维发育相关miRNAs及其靶基因
棉花miRNA 高通量测序 棉花D5基因组 靶基因预测
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2014/4/1
miRNA（microRNA）是一类21～24个核酸长度的非编码小分子RNA（sRNA），它主要通过抑制或降解靶基因来调控植物生长发育等过程。试验利用在纤维长度上有显著差异的2个回交自交系BILs（Backcross inbred lines）的0 DPA（Days post anthesis）、3 DPA的胚珠和10 DPA的纤维构建6个sRNA文库并进行Solexa 测序。以已公布的棉花D5 ...
摘要根据位于小麦第四同源群上与耐盐有关的gf-2.8基因的编码区序列设计1对引物,分别以两个耐盐突变体及其亲本的总DNA为模板进行PCR扩增,在5个供试材料中均扩增出1条约685bp的目的条带。SSCP电泳显示突变体974915与其他供试材料之间存在差异。测序表明冀麦24和其耐盐突变体8901-17的扩增产物序列与gf-2.8基因的发表序列相同,这表明突变体8901-17的突变位点不在该基因上;而...
PCR产物直接测序技术中影响因素的研究
聚合酶链反应（PCR） PCR产物直接测序 ABI-377型DNA自动测序仪 Q20
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2007/12/29
探讨了PCR产物直接测序技术中的影响因素，结果表明：PCR产物特异性是影响其测序成败的关键因素，PCR反应只有产生惟一扩增产物时，其产物才能被用来直接测序；PCR反应体系残留混合物（dNTP、引物和盐离子等）对其测序质量有明显不利影响，PCR产物纯化后其测序质量能明显提高；同时，PCR产物大小不同，其测序反应的模板用量也不同，在一定长度范围内，最适模板用量随PCR产物长度增加而增加。