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Gossypol Broadly Inhibits Coronaviruses by Targeting RNA-Dependent RNA Polymerases
棉花 次生代谢物 棉酚 抑制冠状病毒
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2024/4/16
研究团队以SARS-CoV-2为实验模型，采用计算机高通量筛选、酶学验证、抗病毒实验和冷冻电镜表征等多学科交叉的方式，从棉花中筛选到一种重要的次生代谢物——棉酚，发现棉酚能够广谱抑制冠状病毒。研究结果开辟了多学科交叉和多元化利用新方向，对促进棉花天然产物的研究和利用、拓宽棉花副产品的价值链具有重要意义。
Comprehensive review and assessment of computational methods for predicting RNA post-transcriptional modification sites from RNA sequences
N1-甲基腺苷 N6-甲基腺苷位点 计算方法
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2024/5/17
对27种预测N1-甲基腺苷和N6-甲基腺苷位点的最先进方法的全面综述，涵盖了对开发成功预测器至关重要的各种重要方面，包括数据集质量、操作算法、序列和基因组特征、特征选择、模型性能评估和软件效用。同时提出了一种基于深度学习技术的计算方法DeepPromise，用于同时预测N1 -甲基腺苷和N6 -甲基腺苷。开发了一个web服务器，该服务器可以接受RNA序列和基因组序列，以预测两种假定的RNA修饰位点...
An integrated platform and meta-learner for feature engineering machine learning analysis and modeling of DNA, RNA and protein sequence data
python 工具包 蛋白质序列
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2024/5/17
一个全面和通用的基于python的工具包，集成了特征提取、聚类、归一化、选择、降维、预测器构建、最佳描述符/模型选择、集成学习和DNA、RNA和蛋白质序列结果可视化的功能。用户只需要上传自己的数据集，并从中计算出自己需要的功能，所有必要的程序和优化设置都由软件自动完成。iLearn包括DNA、RNA和蛋白质的各种描述符，支持四种特征输出格式，以便于直接使用输出或与其他计算工具通信。总的来说，iLe...
甘薯茎总RNA的简易高效提取方法
RNA提取 甘薯
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2009/4/14
本文介绍了一种快速有效的提取甘薯[Ipomoea Batatas (L.)Lam]茎总RNA的简易方法，无需特殊试剂和贵重的仪器设备，可有效的去除甘薯中的多酚、多糖类物质。所提取的RNA经过甲醛凝胶电泳和紫外线分光光度计分析，RNA的质量较高，基本没有降解，可直接用于cDNA合成，Northern杂交等多种分子生物学实验。