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中国农业科学院棉花研究所专利：与陆地棉纤维强度一般配合力关联的SNP分子标记
陆地棉 纤维强度 SNP 分子标记
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2024/5/11
本发明公开与陆地棉纤维强度一般配合力相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记位于SEQ ID No.1～SEQ ID No.146任一所示核苷酸序列的第50位核苷酸。本发明提供的与陆地棉纤维强度一般配合力相关的SNP分子标记可以用于陆地棉纤维强度一般配合力的早期预测和筛选，还可以用于纤维强度一般配合力的分子标记辅助育种。其直接以DNA的形式表现，不存在表达与否等问题。在陆地棉的各个组织、各个发育阶...
本发明公开了一种与陆地棉纤维长度主效QTL位点qFL-chr06-2、qFL-chr11-1、qFL-chr16-1、qFL-chr17-2、qFL-chr19-1和qFL-chr26-1紧密连锁的分子标记，本发明利用鲁棉研28×新陆早24陆地棉种内重组自交系群体，通过在新疆和黄河流域两地的多年多点9个环境下，对该重组自交系群体进行棉花纤维长度进行表型鉴定。同时利用棉花SNP80K芯片对该群体进行...
中国农业科学院棉花研究所专利：来源于新陆早24的单铃重主效基因的SNP分子标记
新陆早24 单铃重 主效基因 SNP分子标记
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2024/4/11
本发明公开了一种与陆地棉单铃重的主效QTL位点qBW-chr04-2、qBW-chr05-5、qBW-chr06-3、qBW-chr21-4和qBW-chr24-1紧密连锁的分子标记，本发明利用鲁棉研28×新陆早24杂交组合构建的陆地棉种内重组自交系群体，通过在西北内陆棉区和黄河流域棉区的多年多点环境下，对该重组自交系群体进行棉花产量主要构成因素——单铃重进行表型评价和鉴定。之后利用棉花SNP80...
QTLs identification for nitrogen and phosphorus uptake-related traits using ultra-high density SNP linkage
QTL F2 populations QTL mapping Nitrogen Phosphorus Rice
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2023/4/21
To understand the genetic basis of nitrogen and phosphorus uptake in the cultivated rice, quantitative trait loci (QTL) analysis for 7 nitrogen and phosphorus uptake-related traits including above-gro...
水稻直播由于省时、省工和节约成本而备受农户关注。然而, 芽期耐冷性不强致使现行推广的许多优良水稻品种不适于直播生产。因此, 挖掘鉴定芽期耐冷位点, 为后续的辅助育种提供基因资源就日益受到重视。本研究利用丽江新团黑谷和沈农265构建的重组自交系群体及其重测序构建的包含2818个bin标记的遗传图谱对水稻芽期的耐冷性进行QTL定位分析。共检测到5个芽期耐冷QTL, 分布在水稻的1号、3号、9号和11号...
为鉴定EMS突变的真实性,本研究利用SSR标记和90 K SNP芯片对小麦品系H261及其EMS突变体进行检测。SSR检测结果表明,H261与LF2010和LF2099的差异SSR标记为0个,但与LF2100的差异SSR标记为10个,多态性比例为47.62%。SNP芯片分析结果表明,H261与LF2010和LF2099之间的差异位点分别为66和12个,分别占总数的0.080 9%和0.014 7%...
探讨中国荷斯坦牛CXCR1基因编码区SNP突变与临床乳房炎和生产寿命的相关性。【方法】根据CXCR1基因编码区序列，利用PCR-直接测序法对低SCS和高SCS样本各20个样本进行SNP筛查，最后对所选择的4个SNP位点利用飞行质谱法对866头中国荷斯坦牛进行检测，同时收集所检测牛只临床乳房炎和生产寿命等信息，利用多因素方差分析法、Logistic回归、Cox生存回归等方法分析以上SNP位点突变与临...
采用生物信息学方法将大豆EST序列联配到大豆基因组序列上，挖掘到大豆EST-SNP位点537个。对其靶向基因进行功能注释分析，发现它们主要参与亚细胞定位、蛋白质结合与催化以及代谢等与大豆重要农艺性状形成相关的生物过程。同时开发了简便易行的SNP检测方法，利用EMBOSS软件筛选导致酶切位点改变的EST-SNP，分别以大豆绥农14、合丰25、Acher、Evans、Peking、PI209332、固...
烟草线粒体基因atp6的SNP及其与CMS的相关性
烟草 CMS atp6基因 单核苷酸多态性
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2009/10/30
为更好地在烟草育种中利用雄性不育，对烟草胞质雄性不育(CMS)的分子机理进行了研究。atp6基因是影响植物CMS的一个重要候选基因。本研究以7个烟草CMS系及其相应的保持系为材料，利用PCR特异引物扩增其线粒体基因atp6，通过直接测序和比对，发现atp6中A-59C、T-92C、T-185G、T-253C、T-418C、T-768C 6个核苷酸位点存在碱基变异，其中第59位、92位、185位和4...
InDel和SNP标记在水稻图位克隆中的应用
插入缺失长度多态性 单核苷酸多态性 分子标记 生物信息学
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2008/12/11
在水稻功能基因的图位克隆中，常需要高密度的分子标记，而目前公布的各种标记的密度还远未达到令人满意的程度。InDel和SNP标记是新型的分子标记类型，基本可以满足精细定位目的基因的需要。InDel和SNP标记可以较容易地通过生物信息学的方法获得，而且经济实用、特异性高、稳定性好。介绍了设计InDel和SNP标记的方法，并以一个水稻卷叶基因的研究为实例，介绍了在基因精细定位研究中利用这两种标记的方法和...
分子标记辅助选择逐步成为植物育种的重要方法。然而需要更多的实用的分子标记，尤其是与重要农艺性状紧密连锁的标记。目前，许许多多的方法已经应用到棉花结构基因组的标记开发，但是棉花SNP标记鲜见报道。FIF1基因是棉纤维优势表达的一个基因，研究证明它在棉纤维的发育过程中起着很重要的调控作用。根据已发表的亚洲棉FIF1基因，设计特异引物，克隆了陆地棉TM-1和海岛棉海7124中FIF1基因。根据2个四倍体...
一种大豆SNP分型新方法
大豆 SNP 分型 片段长度差异等位基因特异性PCR
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2015/9/7
单核苷酸多态性（SNP）在大豆基因组中分布广泛，SNP分型是大豆SNP遗传作图，关联分析、分子标记辅助选择等研究的重要技术。本文以Rhg4基因开发的5个SNP为例，介绍了一种大豆SNP分型的新方法-片段长度差异等位基因特异性PCR（FLDAS-PCR）。采用AS-PCR原理，针对某个SNP位点设计2条相差4-5bp的特异引物和1个公用引物，PCR产物约100bp或150bp，2种等位基因型PCR产...