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华中农业大学学者在RNA异戊烯基修饰(i6A)研究中取得新进展（图）
RNA 异戊烯基 i6A TRIT1基因
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2024/3/21
近日，Nucleic Acids Research杂志在线发表了华中农业大学生命科学技术学院周志鹏教授课题组、华中科技大学王锐教授课题组和纽约州立大学奥尔巴尼分校Jia Sheng教授课题组的共同研究成果，论文题目为“Bioorthogonal Labeling and Profiling of N6-isopentenyladenosine (i6A) Modified RNA”。该论文首次报道...
本发明公开了分子生物学技术领域的一种果树中高糖多酚类果实组织RNA的提取方法，包括以下步骤：(1)、取100-150mg粉末状的果实样品至液氮提前预冷的离心管内，立即加入1000μL 2×CTAB提取缓冲液和30μL2％β-巯基乙醇，涡旋震荡混匀，65℃水浴10min；(2)、向步骤(1)离心管中加入与提取缓冲液等体积、体积比为24：1的氯仿和异戊醇混合液，冰浴10min，充分颠倒混匀3-5次，于...
中国农业大学植物保护学院彩万志/李虎/段元格团队描绘重要药用昆虫九香虫A-to-I RNA编辑图谱并解析其演化规律（图）
药用昆虫 九香虫 A-to-I RNA 编辑图谱 演化规律
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2024/5/23
近日，中国农业大学植物保护学院彩万志/李虎/段元格团队在《细胞和分子生命科学》（Cellular and Molecular Life Sciences）在线发表了题为《首个半翅目昆虫九香虫的A-to-I RNA编辑图谱揭示早期分化昆虫类群中存在大量重编码及内含子编辑位点》的研究论文。该研究以重要药用昆虫九香虫Coridius chinensis为研究材料，在半翅目昆虫中首次描绘了A-to-I R...
浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室通过国际合作研究揭示RNA结合蛋白在被子植物多倍化后趋同平行进化以适应全球大降温（图）
RNA 结合蛋白 被子植物 RBP基因 趋同进化
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2024/3/5
多倍化或全基因组复制（whole genome duplication, WGD）被认为是被子植物环境适应性进化的一种重要机制。WGD事件后，物种重新二倍化过程中大量基因丢失，但与环境适应相关的基因被保留了下来（Songet al., 2020, Horticulture Research; Wuet al., 2020, Molecular Plant）。对被保留的基因，前人研究主要集中于转录因...
中国科学院科学家研发出单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法（图）
细胞 空间 学习算法
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2024/2/22
环形RNA是一类广泛表达的非编码RNA，有较高的细胞类型及组织表达特异性，在器官发育及肿瘤发生等过程中起着重要调控作用。环形RNA由3‘端的受体位点和5’端的供体位点共价连接形成，这一过程被称为反向剪接，然而由于缺少poly(A)尾，环形RNA无法被经过polyA富集等转录组建库方式有效捕获。因此，环形RNA的表达信息在绝大部分单细胞以及空间转录组数据中缺失。为了获得丰富的单细胞及空间水平的环形R...
中国科学院大连化学物理研究所专利：一种产油微生物RNA的提取方法
中国科学院大连化学物理研究所 专利 产油 微生物 RNA 提取方法
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2024/1/26
本发明公开了一种从产油微生物中提取RNA的方法。该方法包括以下步骤：产油微生物菌体采用液氮研磨和玻璃珠振荡相结合的方式进行细胞破碎，在细胞破碎液中加入有机溶剂去除油脂，加入酸性苯酚/氯仿/异戊醇除去蛋白，离心取水相加入异丙醇沉淀，最后经乙醇洗涤沉淀，真空干燥，可成功提取产油微生物RNA。本发明操作简单，成本低，完整性好。采用本方法获得的RNA，可以满足产油微生物分子生物学如Northern杂交、m...
Analysis of Arabidopsis seedling responses to daytime temperature regimes identifies an mRNA hairpin as a novel thermosensor in plants.
Protocol: low cost fast and efficient generation of molecular tools for small RNA analysis
Vector Target mimic miRNA, Cloning Plant Downregulation
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2024/1/19
Small RNAs are sequence-dependent negative regulators of gene expression involved in many relevant plant processes such as development, genome stability, or stress response. Functional characterizatio...
近日，植物保护学院作物病原真菌功能基因组学研究团队在《Science Advances》上在线发表题为“Adaptive advantages of restorative RNA editing in fungi for resolving survival-reproduction trade-offs”的论文，齐朝妹博士为论文第一作者，刘慧泉教授为通讯作者。
2024年1月12日，中国农业科学院兰州兽医研究所草食动物细菌病团队在国际学术期刊EMBO Reports发表了题为DDX5 inhibits inflammation by modulating m6A levels of TLR2/4 transcripts during bacterial infection的研究论文，该研究揭示了RNA解螺旋酶DDX5通过mRNA m6A修饰调控TLR2/...
中国科学院遗传发育所利用环状RNA开发出基于Cas12a的引导编辑器（图）
遗传发育 引导编辑器 基因
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2024/1/12
基于CRISPR-Cas9的引导编辑器（prime editors，PEs）可同时实现任意碱基类型的精准替换，以及小片段的精准插入、替换和删除。目前，几乎所有的引导编辑器均是依赖于Cas9蛋白开发而成，但Cas9蛋白存在尺寸较大、脱靶效应高和受限于G/C-rich区域编辑的缺点，限制了引导编辑器的广泛应用。如何进一步提升引导编辑器的编辑精度、消除靶点序列限制并降低递送难度是基因组编辑领域亟待解决的...
中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组利用环状RNA开发基于Cas12a的引导编辑器（图）
高彩霞 编辑 蛋白
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2024/2/28
基于CRISPR-Cas9的引导编辑器（prime editors, PEs）能同时实现任意碱基类型的精准替换，及小片段的精准插入、替换和删除。目前，几乎所有的引导编辑器均是依赖于Cas9蛋白开发而成，但Cas9蛋白存在尺寸较大、脱靶效应高和受限于G/C-rich区域编辑的缺点，限制了引导编辑器的广泛应用。如何进一步提升引导编辑器的编辑精度、消除靶点序列限制并降低递送难度是基因组编辑领域亟待解决的...
上海科技大学生命科学与技术学院刘如娟课题组与合作者综述tRNA来源小RNA功能机制（图）
tRNA 小RNA 功能机制
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2024/3/4
2023年1月5日，上海科技大学生命科学与技术学院刘如娟教授与瑞典隆德大学Cristian Bellodi教授受邀在国际学术期刊Nature Reviews Molecular Cell Biology 在线发表了题为“Roles and regulation of tRNA-derived small RNAs in animals”的综述，总结了tRNA来源的小RNA(tRNA-derived...
科学家开发一款多功能植物小RNA分析工具（图）
RNA 数据分析 科学家
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2024/1/5
近日，《科学通报》在线发表了华南农业大学园艺学院教授夏瑞团队最新研究成果，他们研究开发出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer，可便于研究人员进行一站式小RNA分析及可视化。
中国科学院微生物所邓涛研究团队揭示流感病毒NS2蛋白调控病毒RNA复制的作用机制（图）
邓涛 流感病毒 蛋白调控
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2024/2/27
2023年12月6日，中国科学院微生物研究所邓涛研究团队在期刊Journal of Virology在线发表论文，题为“Twenty natural amino acid substitution screening at the last residue 121 of influenza A virus NS2 protein reveals the critical role of NS2 i...